RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518059.5

UBXN8-204, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-204ENST00000518059 PCSK5Q92824 1860 aa6.51□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 MED12Q93074 2177 aa6.51□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ARGFXA6NJG6 315 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 SERPINE3A8MV23 424 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 H3BUI4 141 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 M0R233 179 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 AKR7A2O43488 359 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 CA11O75493 328 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 OR2A4O95047 310 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 IFNA7P01567 189 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 CSN2P05814 226 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 OR4E1P0C645 316 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF735P0CB33 412 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 TMEM225BP0DP42 221 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 NAT2P11245 290 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 MGMTP16455 207 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 AMY2BP19961 511 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 SDHBP21912 280 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 CD34P28906 385 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF81P51508 661 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 TAS2R46P59540 309 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ARG2P78540 354 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 PSG4Q00888 419 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 SLC10A1Q14973 349 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 Q5BKY6 102 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 FTMTQ8N4E7 242 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 OR4K15Q8NH41 348 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 PIGTQ969N2 578 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 APH1AQ96BI3 265 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 SGK3Q96BR1 496 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 BORCS8Q96FH0 119 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 OR2A7Q96R45 310 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 HES7Q9BYE0 225 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 BANF2Q9H503 90 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 LDAHQ9H6V9 325 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 CALHM2Q9HA72 323 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 GPR173Q9NS66 373 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 NCKAP5O14513 1909 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 A0A0A6YYD4 124 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 A6NL46 340 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 E9PLN8 166 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 L7N2F9 121 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 MFNGO00587 321 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 SOCS1O15524 211 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 SLC22A5O76082 557 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 CELA3AP09093 270 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 COX5BP10606 129 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF35P13682 527 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 NAT1P18440 290 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 SERPINA2P20848 420 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 HRH1P35367 487 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ARR3P36575 388 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 HTR2BP41595 481 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 OR3A3P47888 321 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 OR3A2P47893 321 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 RBP2P50120 134 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ATP1B3P54709 279 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 MTCP1P56278 107 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 PER3P56645 1201 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 DHODHQ02127 395 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN8-204ENST00000518059 PLP2Q04941 152 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms