RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
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PDE4D-220ENST00000512069 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
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PDE4D-220ENST00000512069 ACOT2P49753 483 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CCR8P51685 355 aa3.1□□□□□ -1.91
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PDE4D-220ENST00000512069 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
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PDE4D-220ENST00000512069 OR13C9Q8NGT0 318 aa3.1□□□□□ -1.91
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PDE4D-220ENST00000512069 TESCQ96BS2 214 aa3.1□□□□□ -1.91
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PDE4D-220ENST00000512069 BMFQ96LC9 184 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 TEAD3Q99594 435 aa3.1□□□□□ -1.91
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PDE4D-220ENST00000512069 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
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PDE4D-220ENST00000512069 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MTCH1Q9NZJ7 389 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CD274Q9NZQ7 290 aa3.1□□□□□ -1.91
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PDE4D-220ENST00000512069 FAM25AB3EWG3 89 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 FAM25CB3EWG5 89 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 FAM25GB3EWG6 89 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.09□□□□□ -1.91
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PDE4D-220ENST00000512069 CHP2O43745 196 aa3.09□□□□□ -1.91
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PDE4D-220ENST00000512069 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.09□□□□□ -1.91
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