RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 SYNGR1O43759 233 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 CLIC3O95833 236 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC6A6P31641 620 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 GNALP38405 381 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 DYNLT3P51808 116 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC7A2P52569 658 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 METTL21CQ5VZV1 264 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM185AQ8N0U4 392 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 OR4K13Q8NH42 304 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 FANK1Q8TC84 345 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 OR5M11Q96RB7 305 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 MICU1Q9BPX6 476 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 RTL8AQ9BWD3 113 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ABCB9Q9NP78 766 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 NLKQ9UBE8 527 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF222Q9UK12 451 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ENPP4Q9Y6X5 453 aa11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 V9GYY5 206 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRPF40A-211ENST00000493468 ANXA2P2A6NMY6 339 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 OR2AT4A6NND4 320 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 IDH3BO43837 385 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TFF1P04155 84 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 H1F0P07305 194 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC2A1P11166 492 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CFL1P23528 166 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 PRKXP51817 358 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM76BQ5HYJ3 339 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CBLL1Q75N03 491 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM219Q86XT9 240 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 FTMTQ8N4E7 242 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 C11orf42Q8N5U0 333 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 FN3KQ9H479 309 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ABCB10Q9NRK6 738 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 C19orf12Q9NSK7 152 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.45□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 LYSTQ99698 3801 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1W2PPE2 198 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1W2PR64 198 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1W2PRV1 198 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF878C9JN71 531 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 MRASO14807 208 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF682O95780 498 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 RPS27P42677 84 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC25A1P53007 311 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ERVFRD-1P60508 538 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 GMFBP60983 142 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 BLCAPP62952 87 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TIGD6Q17RP2 521 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 KLHL12Q53G59 568 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 FGD3Q5JSP0 725 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 Q6ZS46 218 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 FKBP9P1Q75LS8 142 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 RNF144BQ7Z419 303 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 DCXRQ7Z4W1 244 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM185AQ8NFB2 350 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 MALSU1Q96EH3 234 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SDSLQ96GA7 329 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 REEP6Q96HR9 211 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 HSH2DQ96JZ2 352 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 OR52D1Q9H346 318 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SP140LQ9H930 580 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 MRGBPQ9NV56 204 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 USE1Q9NZ43 259 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CD300AQ9UGN4 299 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 AP3M1Q9Y2T2 418 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.44□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 DNAH1Q9P2D7 4330 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ODF3BA8MYP8 253 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TBX1O43435 398 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 AKR7A2O43488 359 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 RHBDL1O75783 438 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ZFPL1O95159 310 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 PSKH1P11801 424 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 COX7A1P24310 79 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 DCTDP32321 178 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms