RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CLDN34H7C241 214 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PRKYO43930 277 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GPR137BO60478 399 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TIPRLO75663 272 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 APOL3O95236 402 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TSPAN15O95858 294 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 IFNGP01579 166 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 LYNP07948 512 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 DCTDP32321 178 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 DAPP51397 102 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GPM6AP51674 278 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CDK5Q00535 292 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SPATA24Q86W54 205 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 C1QL4Q86Z23 238 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 OTOSQ8NHW6 89 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ERGIC1Q969X5 290 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ASB9Q96DX5 294 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 LRGUKQ96M69 825 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF732B4DXR9 585 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 P2RY10O00398 339 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GNGT2O14610 69 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SYNGR1O43759 233 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 FKBP6O75344 327 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 E2F6O75461 281 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 INMTO95050 263 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 FSTL3O95633 263 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 FAM107AO95990 144 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 KNG1P01042 644 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 OSMP13725 252 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 FAHP16930 419 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CALB2P22676 271 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 IER3P46695 156 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 IL13RA1P78552 427 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CBX1P83916 185 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 HCP5Q6MZN7 132 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 Q6ZSV7 163 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SHFQ7M4L6 423 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SSX6Q7RTT6 188 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 LINC01006Q8NI28 216 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RNF170Q96K19 258 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TEAD3Q99594 435 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 APOL4Q9BPW4 351 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SLC22A4Q9H015 551 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 OR10A2Q9H208 303 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 YY1AP1Q9H869 796 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 FAM206AQ9NX38 181 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 NDE1Q9NXR1 346 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 NDUFB7P17568 137 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ALOX5APP20292 161 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SAA4P35542 130 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GNALP38405 381 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SLC15A1P46059 708 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GABRA2P47869 451 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TGM4P49221 684 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 NPY4RP50391 375 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 LY6EQ16553 131 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MICBQ29980 383 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ODF4Q2M2E3 257 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SPATS1Q496A3 300 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CDONQ4KMG0 1287 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MIDNQ504T8 468 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CD276Q5ZPR3 534 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 BRICD5Q6PL45 260 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MOB3CQ70IA8 216 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 KRT77Q7Z794 578 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CD177Q8N6Q3 437 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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