RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 SLC6A9P48067 706 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 RIDAP52758 137 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TAS2R19P59542 299 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 KCNK15Q9H427 330 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 AIPO00170 330 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 GPR31O00270 319 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 MED6O75586 246 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 B3GALNT1O75752 331 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 LYZL6O75951 148 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 MPIG6BO95866 241 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TGM6O95932 706 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 H2BFMP0C1H6 154 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CXCL2P19875 107 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ADH6P28332 368 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF83P51522 516 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 RAC3P60763 192 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SGCAQ16586 387 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 AVPI1Q5T686 147 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 C5orf46Q6UWT4 87 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 COMTD1Q86VU5 262 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 OR6K3Q8NGY3 331 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 FBXO17Q96EF6 278 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF75AQ96N20 296 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 INTS14Q96SY0 518 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 AICDAQ9GZX7 198 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 AKAP13Q12802 2813 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 A0A0G2JNJ9 132 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 RAB19A4D1S5 217 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 GGT3PA6NGU5 568 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TNFSF12O43508 249 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SCGNO76038 276 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TSPAN15O95858 294 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 IFNA21P01568 189 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 IGHG3P01860 377 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 SERPINA5P05154 406 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CTRB1P17538 263 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 AMY2BP19961 511 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 HSD11B1P28845 292 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CSNK1A1P48729 337 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 FABP6P51161 128 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CLDN17P56750 224 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 IGSF11Q5DX21 431 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 OR10Z1Q8NGY1 313 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 NEK7Q8TDX7 302 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PTP4A1Q93096 173 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 C14orf79Q96F83 325 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ULBP2Q9BZM5 246 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 Q9UFV3 132 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.29□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PLSCR5A0PG75 271 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM235A6NFC5 223 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PLPP2O43688 288 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TSPAN2O60636 221 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TBX19O60806 448 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 PI3P19957 117 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 GCH1P30793 250 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 LIMS1P48059 325 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 DIO1P49895 249 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF117Q03924 483 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 FAM27E3Q08E93 113 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 P2RY6Q15077 328 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 MEP1BQ16820 701 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 ADAM5Q6NVV9 412 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 STAC2Q6ZMT1 411 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 FAM219AQ8IW50 185 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 RFLNBQ8N5W9 214 aa5.28□□□□□ -1.56
SHQ1-205ENST00000468371 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms