RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 DIO1P49895 249 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CLDN17P56750 224 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 HBG1P69891 147 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 HBG2P69892 147 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CRMP1Q14194 572 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR1S1Q8NH92 325 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SCMH1Q96GD3 660 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TRIB1Q96RU8 372 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 GLCEO94923 617 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CRYBB2P43320 205 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MMP15P51511 669 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 BOD1Q96IK1 185 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 A6NIN4 97 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 NCR1O76036 304 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CD1AP06126 327 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SERPINE2P07093 398 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 NQO2P16083 231 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SDHAP31040 664 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR2B8PP59922 312 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZNF117Q03924 483 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 VAMP3Q15836 100 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 RND1Q92730 232 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MIB2Q96AX9 1013 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 BORCS8Q96FH0 119 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SEC22AQ96IW7 307 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 UHRF2Q96PU4 802 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 RASL10BQ96S79 203 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CALHM2Q9HA72 323 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 FAM186AA6NE01 2351 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 A6NLC8 198 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MPIG6BO95866 241 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TXNDC12O95881 172 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LPLP06858 475 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CD37P11049 281 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 GRPRP30550 384 aa6.84□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 BVESQ8NE79 360 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MIOXQ9UGB7 285 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 GAB2Q9UQC2 676 aa6.84□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR2W5A6NFC9 320 aa6.83□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 SLC2A10O95528 541 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SERPINA5P05154 406 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SP1P08047 785 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CHRM2P08172 466 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 HOXB5P09067 269 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ZNF17P17021 662 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 CD226Q15762 336 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OR2T2Q6IF00 324 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OR4K15Q8NH41 348 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 TSSK2Q96PF2 358 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PPV4 95 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 FAM183AA6NL82 134 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CD300LBA8K4G0 201 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 LGALS8O00214 317 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 LCATP04180 440 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CLDN15P56746 228 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 PKIAP61925 76 aa6.83□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.83□□□□□ -1.32
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