RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FJX1Q86VR8 437 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR8S1Q8NH09 359 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CMBLQ96DG6 245 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAB3CQ96E17 227 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BANF2Q9H503 90 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OPA3Q9H6K4 179 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KLK13Q9UKR3 277 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A0A1B0GUH1 482 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAB3DO95716 219 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 APLNRP35414 380 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RBP2P50120 134 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR2A2Q6IF42 318 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WNT2BQ93097 391 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DMRTB1Q96MA1 342 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NICN1Q9BSH3 213 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BEX2Q9BXY8 128 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IFT46Q9NQC8 304 aa15.1■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR14I1A6ND48 311 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ICMTO60725 284 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MGMTP16455 207 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GNG2P59768 71 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TNK1Q13470 666 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MEF2DQ14814 521 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARL6IP1Q15041 203 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR51T1Q8NGJ9 327 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GINS4Q9BRT9 223 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AHRRA9YTQ3 701 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GNB3P16520 340 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SERPINA2P20848 420 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FOXC1Q12948 553 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DMRTC1Q5HYR2 192 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CRIP3Q6Q6R5 217 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MED12LQ86YW9 2145 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC36Q8IYA8 594 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 POM121L2Q96KW2 1035 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 METTL9Q9H1A3 318 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FLVCR2Q9UPI3 526 aa15.09■□□□□ 0.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WIPF3A6NGB9 483 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CD74P04233 296 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMEM225BP0DP42 221 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CPT2P23786 658 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MECP2P51608 486 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FUT6P51993 359 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP1B3P54709 279 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HIKESHIQ53FT3 197 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 Q6ZS92 163 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR51S1Q8NGJ8 323 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A0A0A6YYD4 124 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SSNA1O43805 119 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZP1P60852 638 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KCNJ8Q15842 424 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FTMTQ8N4E7 242 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM89BQ8N5H3 189 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MED30Q96HR3 178 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TAAR6Q96RI8 345 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TM2D1Q9BX74 207 aa15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A0A1W2PP11 408 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DISC1C4P0D8 188 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IL5P05113 134 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FCN2Q15485 313 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GUSBP1Q15486 140 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ST3GAL2Q16842 350 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MOB3CQ70IA8 216 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NOXA1Q86UR1 476 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR6K3Q8NGY3 331 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PIGCQ92535 297 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RTTNQ86VV8 2226 aa15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms