RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438356.1

RBM33-208, Transcript of RNA binding motif protein 33, human

TSL 4

Gene RBM33, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM33-208	ENST00000438356	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	LMO4	P61968	165 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	SLC34A1	Q06495	639 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	PRDX4	Q13162	271 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	IL18R1	Q13478	541 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	MED21	Q13503	144 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ZMYND11	Q15326	602 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	TP53I3	Q53FA7	332 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	DOK3	Q7L591	496 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	TMEM186	Q96B77	213 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	C1orf159	Q96HA4	380 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	RNF170	Q96K19	258 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	AMBN	Q9NP70	447 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	MIOX	Q9UGB7	285 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	FAM157A	C9JC47	383 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356		J3QLW9	94 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	P2RY10	O00398	339 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	SYT7	O43581	403 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF205	O95201	554 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	PNP	P00491	289 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	SERPINA3	P01011	423 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF12	P17014	697 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF19	P17023	458 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ACKR3	P25106	362 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	CAPG	P40121	348 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	MPPED2	Q15777	294 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ODF4	Q2M2E3	257 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ESCO2	Q56NI9	601 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF691	Q5VV52	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	SSX6	Q7RTT6	188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	LYZL4	Q96KX0	146 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	AASS	Q9UDR5	926 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356		A0A0G2JMP0	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356		A0A0X1KG70	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356		H0YAE9	185 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	NDUFA2	O43678	99 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	FSTL3	O95633	263 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	TTR	P02766	147 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	HTR1A	P08908	422 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	GABRB1	P18505	474 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	MYL12A	P19105	171 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	PMEL	P40967	661 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	GNG3	P63215	75 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF85	Q03923	595 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	SCGB2A2	Q13296	93 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	GALE	Q14376	348 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	RORB	Q92753	470 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	OR8B2	Q96RD0	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ALG8	Q9BVK2	526 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	TMEM165	Q9HC07	324 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	ANK2	Q01484	3957 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	OR5B21	A6NL26	309 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM33-208	ENST00000438356	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		10.11	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms