RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 SLC36A2Q495M3 483 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF774Q6NX45 483 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 NANPQ8TBE9 248 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF75AQ96N20 296 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 NIPAL2Q9H841 368 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CA10Q9NS85 328 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CENPMQ9NSP4 180 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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ATG4B-211ENST00000429899 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM212A6NML5 194 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TIMM23O14925 209 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 AIREO43918 545 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TSPAN15O95858 294 aa8.53□□□□□ -1.04
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ATG4B-211ENST00000429899 FSHBP01225 129 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 COX5BP10606 129 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 GALP22466 123 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CX3CR1P49238 355 aa8.53□□□□□ -1.04
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ATG4B-211ENST00000429899 NCS1P62166 190 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TUBA1BP68363 451 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 FABP5Q01469 135 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TGFBR3Q03167 851 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 SLC3A1Q07837 685 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ECH1Q13011 328 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 FAM189A2Q15884 450 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 VHLLQ6RSH7 139 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TUBA1AQ71U36 451 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 GHSRQ92847 366 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 KCNJ15Q99712 375 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CENPOQ9BU64 300 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TMED9Q9BVK6 235 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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ATG4B-211ENST00000429899 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC160A6NGH7 325 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 M0R135 149 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 GABRPO00591 440 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 SLC22A1O15245 554 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 IGLV3-1P01715 115 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 TTRP02766 147 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 DBHP09172 617 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 ACSM4P0C7M7 580 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 HSD11B1P28845 292 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 ARR3P36575 388 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 TGFBR1P36897 503 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 HTR5AP47898 357 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 PRKXP51817 358 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 BAMBIQ13145 260 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 INSL4Q14641 139 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 SPCS2Q15005 226 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 TRAM1Q15629 374 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 GSG1Q2KHT4 349 aa8.52□□□□□ -1.05
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ATG4B-211ENST00000429899 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.52□□□□□ -1.05
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ATG4B-211ENST00000429899 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 NDNFQ8TB73 568 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 SLC7A6Q92536 515 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM203Q969S6 136 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF799Q96GE5 643 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-211ENST00000429899 CITED1Q99966 193 aa8.52□□□□□ -1.05
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