RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428525.1

AC008065.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC008065.1, Length 348 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008065.1-201ENST00000428525 MGRN1O60291 552 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 MPZL1O95297 269 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 PPP1R3DO95685 299 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 IFNA5P01569 189 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ARG1P05089 322 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 H2AFZP0C0S5 128 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 GIMD1P0DJR0 217 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 CT45A10P0DMU9 189 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ZNF35P13682 527 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 GABRG2P18507 467 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 HOXA5P20719 270 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ATP6V1B2P21281 511 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 HSD11B1P28845 292 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ADORA2BP29275 332 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 SEMG2Q02383 582 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ZNF92Q03936 586 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 PRKCDQ05655 676 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 SLC10A7Q0GE19 358 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ASAH1Q13510 395 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 RAB31Q13636 194 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ARL6IP1Q15041 203 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 GUSBP1Q15486 140 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 TWIST1Q15672 202 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 SGCAQ16586 387 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 MARCH8Q5T0T0 291 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 DRAM2Q6UX65 266 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 TMEM150AQ86TG1 271 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 TMEM135Q86UB9 458 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 HORMAD1Q86X24 394 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 HIPK1Q86Z02 1210 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 RDH10Q8IZV5 341 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 CA13Q8N1Q1 262 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 IFT81Q8WYA0 676 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 MED30Q96HR3 178 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ZNF488Q96MN9 340 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ATF6BQ99941 703 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 RNF126Q9BV68 326 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 SRXN1Q9BYN0 137 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 RGS18Q9NS28 235 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 CFL2Q9Y281 166 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 STYXL1Q9Y6J8 313 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 CCDC171Q6TFL3 1326 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa3.35□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 NF1P21359 2839 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 LRBAP50851 2863 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 COL4A2P08572 1712 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 A0A1B0GVI7 797 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 A6NDN8 102 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 DBX1A6NMT0 343 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 TMEM114B3SHH9 223 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 M0QZ92 97 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 CDIPTO14735 213 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 SLC16A4O15374 487 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 CCL16O15467 120 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 LYPLA2O95372 231 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 UTS2O95399 124 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 CD48P09326 243 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 OR8U9P0C7N5 309 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ZP3P21754 424 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 SHC1P29353 583 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 CAPZBP47756 277 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 FABP6P51161 128 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ERVS71-1P61550 626 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 SRPXP78539 464 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 HMGCS1Q01581 520 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 TGFBR3Q03167 851 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 BCL2L1Q07817 233 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 CYP24A1Q07973 514 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 ST3GAL4Q11206 333 aa3.34□□□□□ -1.87
AC008065.1-201ENST00000428525 TFDP2Q14188 446 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms