RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 IGFL2Q6UWQ7 119 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF584Q8IVC4 421 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 DEDD2Q8WXF8 326 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 PRRX2Q99811 253 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 PLATP00750 562 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 GSK3AP49840 483 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 IFITM2Q01629 132 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 OR52W1Q6IF63 320 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM229BQ8NBD8 167 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 C10orf35Q96D05 121 aa20.16■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1B0GUH1 482 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 MTCP1P56278 107 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 FAM3AP98173 230 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 C5orf49A4QMS7 147 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 FABP7O15540 132 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 AMY2AP04746 511 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 NAXEQ8NCW5 288 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 OR52B4Q8NGK2 314 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 RAB3CQ96E17 227 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF69Q9UC07 566 aa20.15■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 C1QBP02746 253 aa20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 UBBP0CG47 229 aa20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 NAT2P11245 290 aa20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 GZMKP49863 264 aa20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM50BP56557 158 aa20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.827e-7■■□□□ 13.2
FAAP20-209ENST00000428120 NKPD1Q17RQ9 610 aa20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 HIKESHIQ53FT3 197 aa20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 METTL11BQ5VVY1 283 aa20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC54Q8NEL0 328 aa20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 CST11Q9H112 138 aa20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 KCNK7Q9Y2U2 307 aa20.14■□□□□ 0.82
FAAP20-209ENST00000428120 TRAV17A0A0B4J275 112 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 EFSO43281 561 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 SSX5O60225 188 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 PRAF2O60831 178 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ALX3O95076 343 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 VSIG10L2P0DP72 767 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ZP1P60852 638 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CD163Q86VB7 1156 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 GCNT2Q8N0V5 402 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 OR51T1Q8NGJ9 327 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 S100A13Q99584 98 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 DHRS7CA6NNS2 312 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 SCGNO76038 276 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CHRM2P08172 466 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 MELTFP08582 738 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 SULT1A3P0DMM9 295 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 SULT1A4P0DMN0 295 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 MGMTP16455 207 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 RAB1AP62820 205 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 RTP5Q14D33 572 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 IDO2Q6ZQW0 420 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 P4HA3Q7Z4N8 544 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ANGPTL7O43827 346 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V1G1O75348 118 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 IL18BPO95998 194 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 RAD51DO75771 328 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM225BP0DP42 221 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 OR5M9Q8NGP3 310 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 SLC6A7Q99884 636 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 PRDM14Q9GZV8 571 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CHST6Q9GZX3 395 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 RGCCQ9H4X1 137 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 IFT46Q9NQC8 304 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 NRASP01111 189 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 IGHG3P01860 377 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ANXA3P12429 323 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 GNG2P59768 71 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 BPIFB2Q8N4F0 458 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 OR56B1Q8NGI3 324 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CD74P04233 296 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 ALDH3B1P43353 468 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 STK11Q15831 433 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 CLVS2Q5SYC1 327 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 PIGCQ92535 297 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 SPSB1Q96BD6 273 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-209ENST00000428120 TRIB1Q96RU8 372 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms