RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 GPR176Q14439 515 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 TRIM16LQ309B1 348 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 TRIQKQ629K1 86 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 OR51A2Q8NGJ7 313 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A38Q96DW6 304 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CDH20Q9HBT6 801 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CACNA1CQ13936 2221 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0G2JMP0 313 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0X1KG70 313 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 OR5H1A6NKK0 313 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 H3BSH0 61 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 GABARAPH6UMI1 98 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 GMDSO60547 372 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 LMX1BO60663 402 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 RAD51DO75771 328 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 LYZL6O75951 148 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ECDO95905 644 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 NRASP01111 189 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV1-44P01699 117 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CHRM2P08172 466 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 GSTT2BP0CG30 244 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 NAT2P11245 290 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SELEP16581 610 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 INPP1P49441 399 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ARL6IP1Q15041 203 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 P2RY14Q15391 338 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 KISS1Q15726 138 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 BAK1Q16611 211 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF787Q6DD87 383 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 WDR31Q8NA23 367 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 POC5Q8NA72 575 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 OR4M2Q8NGB6 313 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 RFT1Q96AA3 541 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 NOX3Q9HBY0 568 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 LUZP4Q9P127 313 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 MED12LQ86YW9 2145 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0B4J203 849 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 C5orf63A6NC05 138 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GGT3PA6NGU5 568 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 A8MXE2 369 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CTAG2O75638 210 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAHP16930 419 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 IL32P24001 234 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ACKR3P25106 362 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PTGFRP43088 359 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RAD52P43351 418 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RBP2P50120 134 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ATP1B3P54709 279 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CLDN12P56749 244 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 AP3S2P59780 193 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 QRFPP83859 136 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TNK1Q13470 666 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 DYRK1AQ13627 763 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2V2Q15819 145 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ANGPTL5Q86XS5 388 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 NAXEQ8NCW5 288 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms