RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 CST2P09228 141 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 JMJD7P0C870 316 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 AKR1C4P17516 323 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 HLA-GP17693 338 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 SERPINA2P20848 420 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 TAS2R31P59538 309 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 ALKAL2Q6UX46 152 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 HOGA1Q86XE5 327 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 OR10D3Q8NH80 312 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 MARCH1Q8TCQ1 289 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 ST8SIA4Q92187 359 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 DDA1Q9BW61 102 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 FREM2Q5SZK8 3169 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 DHRS7CA6NNS2 312 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 OR1F12Q8NHA8 337 aa12.11□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 SEC22AQ96IW7 307 aa12.11□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 REEP6Q96HR9 211 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 CYYR1Q96J86 154 aa12.1□□□□□ -0.47
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PRAME-202ENST00000398743 PECRQ9BY49 303 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 PINLYPA6NC86 204 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 CEACAM18A8MTB9 384 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-202ENST00000398743 SPDEFO95238 335 aa12.09□□□□□ -0.47
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