RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 OSGIN2Q9Y236 505 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 F5H5K5 113 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 VAMP5O95183 116 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 IL32P24001 234 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 PHYHD1Q5SRE7 291 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 CRIP3Q6Q6R5 217 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 NAT6Q93015 286 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 MED12Q93074 2177 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 SNU13P55769 128 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 HIST1H3AP68431 136 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 NAAAQ02083 359 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ARL6IP1Q15041 203 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 HIST2H3AQ71DI3 136 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 C1QL2Q7Z5L3 287 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC54Q8NEL0 328 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 OR5D18Q8NGL1 313 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 PECRQ9BY49 303 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ANGPTL4Q9BY76 406 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 RAB19A4D1S5 217 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 OR5H15A6NDH6 313 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 NPIPA2E9PIF3 369 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 NPIPA3F8WFD2 350 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 STMND1H3BQB6 276 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 FGF16O43320 207 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 CELA2AP08217 269 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 MC2RQ01718 297 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ATRAIDQ6UW56 229 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 NPRL2Q8WTW4 380 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 NABP1Q96AH0 204 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 S100A13Q99584 98 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 KCNAB3O43448 404 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 APOC1P02654 83 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 UBE2V2Q15819 145 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 AADACL3Q5VUY0 350 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZSR3 168 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 OR52H1Q8NGJ2 320 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC46Q96FV0 321 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 TM2D1Q9BX74 207 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHB10Q9UN67 800 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 SERPINE3A8MV23 424 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 LYL1P12980 280 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 IL11RAQ14626 422 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 EXT1Q16394 746 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 SLC16A14Q7RTX9 510 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 SLC30A7Q8NEW0 376 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 OR1S2Q8NGQ3 325 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 RHBDD1Q8TEB9 315 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 C10orf35Q96D05 121 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 CYYR1Q96J86 154 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 CHST5Q9GZS9 411 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 EHFQ9NZC4 300 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 DHHO43323 396 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 CA11O75493 328 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ADAP1O75689 374 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 FCGR2AP12318 317 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 LIFP15018 202 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 RAET1LQ5VY80 246 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 RTL6Q6ICC9 239 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 PRSS54Q6PEW0 395 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF700Q9H0M5 742 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 H0YIZ8 118 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 HPNP05981 417 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 FAHP16930 419 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 PI3P19957 117 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 SERPINA2P20848 420 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 DEFA5Q01523 94 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 PPA1Q15181 289 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD55Q3KP44 614 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 DMRTC1Q5HYR2 192 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 BAP18Q8IXM2 172 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM123Q8N131 208 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 OR9K2Q8NGE7 335 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 HAS2Q92819 552 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 IMMP1LQ96LU5 166 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ASF1BQ9NVP2 202 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 PIGLQ9Y2B2 252 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 MYO7BQ6PIF6 2116 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 HTR3BO95264 441 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 CPT2P23786 658 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC18Q8N456 261 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms