RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRIQ4A6NIV6 560 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX46H3BTG2 121 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDN34H7C241 214 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 XRCC2O43543 280 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJB6O75190 326 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDP2O95551 362 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TGM6O95932 706 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT16P08779 473 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANXA8P13928 327 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 GFAPP14136 432 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 NELFEP18615 380 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 GGT2P36268 569 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP1S2P56377 157 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDN18P56856 261 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2B8PP59922 312 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAB1Q13506 487 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFDP2Q14188 446 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPEL1Q2QD12 228 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 PYDC2Q56P42 97 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANXA8L1Q5VT79 327 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFSD14CQ5VZR4 134 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNC93AQ86WB7 457 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 DRAM1Q8N682 238 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC26A10Q8NG04 563 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52N1Q8NH53 320 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITFG1Q8TB96 612 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCAKDQ8WVC6 231 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDS1Q92903 461 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYNLL2Q96FJ2 89 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 EMC6Q9BV81 110 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TREX1Q9NSU2 369 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCUBQ9NWR8 336 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 RWDD2AQ9UIY3 292 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBED9Q6R2W3 1325 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0A6YYD5 115 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 J3QKU1 62 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 M0R1X1 148 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTNSO60931 367 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMMRO75330 724 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 FSTL3O95633 263 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV2-8P01709 118 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBV12-3P01733 135 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGF4P08620 206 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 APLNRP35414 380 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEA1P43355 309 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS5P46782 204 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF33AQ06730 810 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 HADHQ16836 314 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM131AQ6UXB0 335 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZSR6 202 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM122BQ7Z309 247 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 KATNAL2Q8IYT4 538 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00469Q8N7U9 141 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASZ1Q8WWH4 475 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 RCN3Q96D15 328 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGMATQ9BSE5 352 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD209Q9NNX6 404 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASF1BQ9NVP2 202 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMGXB4Q9UGU5 601 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 SVILO95425 2214 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 MROH7Q68CQ1 1323 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 A8MWL6 223 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA8TH3BQL2 631 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB5O15062 677 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSPHP1O15172 72 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC19A2O60779 497 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPDU1O75352 247 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTHP01270 115 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAS1P04201 325 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 THRAP10827 490 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD82P27701 267 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 HLA-DMAP28067 261 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1G1P47890 313 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TGM4P49221 684 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERFP50548 548 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRF8Q02556 426 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 GBE1Q04446 702 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJC3Q13217 504 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1Q1Q15612 314 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 GABRA6Q16445 453 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 C6orf99Q4VX62 202 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2T5Q6IEZ7 315 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC2AQ6UVW9 174 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB43Q86YS6 212 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ORMDL3Q8N138 153 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A29Q8N8R3 303 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC75AQ8NAA5 344 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52K2Q8NGK3 314 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2T29Q8NH02 315 aa1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms