RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 LGALS12Q96DT0 336 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MICU1Q9BPX6 476 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MMP26Q9NRE1 261 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ACOXLQ9NUZ1 547 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 PIGLQ9Y2B2 252 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SNX5Q9Y5X3 404 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MXRA5Q9NR99 2828 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 TRAPPC2LH3BP13 241 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 H3BSH0 61 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 LGALS8O00214 317 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 FOXH1O75593 365 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 DHRS3O75911 302 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CLIC3O95833 236 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 LHBP01229 141 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 DBTP11182 482 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ATP6V1B1P15313 513 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ODF4Q2M2E3 257 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 WDR38Q5JTN6 314 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CEP78Q5JTW2 689 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 DCAF12L2Q5VW00 463 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 WDR82Q6UXN9 313 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 KRT74Q7RTS7 529 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 FTMTQ8N4E7 242 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 OR14K1Q8NGZ2 314 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC29Q8WV35 223 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 RDH12Q96NR8 316 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 RTL8AQ9BWD3 113 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 TLNRD1Q9H1K6 362 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 AMBNQ9NP70 447 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CTSZQ9UBR2 303 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MIOXQ9UGB7 285 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 GNG8Q9UK08 70 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 V9GYS6 101 aa12.47□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 WNK2Q9Y3S1 2297 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 LOC105371242A0A075B767 164 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0G2JMP0 313 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0X1KG70 313 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 OOEPA6NGQ2 149 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CDIPTO14735 213 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SULT1C4O75897 302 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SRP14P37108 136 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 KIR3DL2P43630 455 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 GPM6AP51674 278 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 CDONQ4KMG0 1287 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ESCO2Q56NI9 601 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 DCDC5Q6ZRR9 648 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 KCTD8Q6ZWB6 473 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 THAP5Q7Z6K1 395 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 FAM90A1Q86YD7 464 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 PRSS35Q8N3Z0 413 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 OR4M2Q8NGB6 313 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SEH1LQ96EE3 360 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 RNF170Q96K19 258 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 ABCB9Q9NP78 766 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 OPN4Q9UHM6 478 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 MYRFQ9Y2G1 1151 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 LRCH1Q9Y2L9 728 aa12.46□□□□□ -0.41
CSAG1-201ENST00000361211 DAPL1A0PJW8 107 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 A6NIN4 97 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MPZL2O60487 215 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 WBP4O75554 376 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GYPAP02724 150 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ADRA2CP18825 462 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CCL1P22362 96 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PITPNBP48739 271 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR12D2P58182 307 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ACTC1P68032 377 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ACTA1P68133 377 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF691Q5VV52 312 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 TEX36Q5VZQ5 186 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PLCXD3Q63HM9 321 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF841Q6ZN19 808 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZSR3 168 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MOB3CQ70IA8 216 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FAM220AQ7Z4H9 259 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SCCPDHQ8NBX0 429 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF555Q8NEP9 628 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR8B3Q8NGG8 313 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR8B2Q96RD0 313 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GPR173Q9NS66 373 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ENPP5Q9UJA9 477 aa12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ERICH4A6NGS2 130 aa12.44□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM210A6NLX4 147 aa12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms