RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 MITD1Q8WV92 249 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 NRIP2Q9BQI9 281 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 DOK2O60496 412 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 KLK2P20151 261 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB25P24278 435 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 MAGEB1P43366 347 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 DNASE1L1P49184 302 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 POU3F4P49335 361 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 SSTP61278 116 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 CYCSP99999 105 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 GUCA2AQ02747 115 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 SLC17A1Q14916 467 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 HMGN3Q15651 99 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 RAB11BQ15907 218 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 RAET1LQ5VY80 246 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 TMPPEQ6ZT21 453 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 PIP4P1Q86T03 277 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 OR4A4PQ8NGN8 299 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 PSMF1Q92530 271 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 PRRT1Q99946 306 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ELOVL3Q9HB03 270 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ACKR4Q9NPB9 350 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 AQP7P3A6NL99 342 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 OR4C45A6NMZ5 311 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 TNFSF15O95150 251 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 P04436 131 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 AMY2AP04746 511 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF735P0CB33 412 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ATP1B3P54709 279 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 SLC35A1P78382 337 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 TMED4Q7Z7H5 227 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM200AQ86VY9 491 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 PRSS35Q8N3Z0 413 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 FAM3DQ96BQ1 224 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 SEH1LQ96EE3 360 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 PHB2Q99623 299 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 NIT2Q9NQR4 276 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ASH2LQ9UBL3 628 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 RAMP1O60894 148 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 CBR3O75828 277 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV2-70P01814 119 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 SLC6A9P48067 706 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 CAV2P51636 162 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ROM1Q03395 351 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 FAM166AQ6J272 317 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF679Q8IYX0 411 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 OR51D1Q8NGF3 324 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 C4orf45Q96LM5 186 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 OXGR1Q96P68 337 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ABHD6Q9BV23 337 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 TUBA4BQ9H853 241 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 SEC61A2Q9H9S3 476 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 HTR3BO95264 441 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 CYB5AP00167 134 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 MAS1P04201 325 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF823P16415 610 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF17P17021 662 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 KIR3DL2P43630 455 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 CAPZA1P52907 286 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 PLA2G7Q13093 441 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM225Q6GV28 225 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 FDX2Q6P4F2 183 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 OR8S1Q8NH09 359 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 RNF128Q8TEB7 428 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 LPAR3Q9UBY5 353 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 FBP1P09467 338 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 AGAP20933 346 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 SOX2P48431 317 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 AKR1C2P52895 323 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 AKR1C1Q04828 323 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 C2orf76Q3KRA6 126 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 NOXO1Q8NFA2 376 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 OR52N5Q8NH56 324 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM106AQ96A25 262 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 NMES1Q9C002 83 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 TM4SF5O14894 197 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 MT-ND4LP03901 98 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 FAM157CP0CG43 387 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 PGA4P0DJD7 388 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 PGA3P0DJD8 388 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-204ENST00000352260 CD37P11049 281 aa16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms