RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 MED20Q9H944 212 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 FUT9Q9Y231 359 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 A0A0A6YYH2 397 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 A6NJ64 397 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 H0YL77 283 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 SPINT1O43278 529 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 NME2P1O60361 137 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 STC2O76061 302 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ONECUT2O95948 504 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 SCGB1A1P11684 91 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ALDH3B1P43353 468 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 EFNB2P52799 333 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 HIST1H3AP68431 136 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 PMS2P11Q13670 270 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 FBLN7Q53RD9 439 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF429Q86V71 674 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF738Q8NE65 137 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ASB11Q8WXH4 323 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 C5orf51A6NDU8 294 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 CDC42EP2O14613 210 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 OR6A2O95222 327 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 GOSR1O95249 250 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 CSTAP01040 98 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 OR5G3P0C626 314 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 CEBPBP17676 345 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 CTRLP40313 264 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 C4orf17Q53FE4 359 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 GRHL3Q8TE85 626 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 RNF128Q8TEB7 428 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 FGF13Q92913 245 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 TOMM40LQ969M1 308 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 C2orf50Q96LR7 162 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ZBP1Q9H171 429 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 PLK3Q9H4B4 646 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 KIAA1456Q9P272 454 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 FBXL17Q9UF56 701 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 MEMO1Q9Y316 297 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 M0QYG6 137 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 F11P03951 625 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 THY1P04216 161 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 CEACAM1P13688 526 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 HLA-DRB3P79483 266 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 TP53I3Q53FA7 332 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 OR8S1Q8NH09 359 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM234Q8WY98 164 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 THRSPQ92748 146 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 LGR4Q9BXB1 951 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.55□□□□□ -1.36
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms