RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OR8B12Q8NGG6 310 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SYNPRQ8TBG9 265 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 CHAC2Q8WUX2 184 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 YIPF5Q969M3 257 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 HDHD2Q9H0R4 259 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM38BQ9NVV0 291 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 RNF115Q9Y4L5 304 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SYT7O43581 403 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 RAD51DO75771 328 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 CST2P09228 141 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 CCL1P22362 96 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 INPP1P49441 399 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 RAB11BQ15907 218 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 GLT8D1Q68CQ7 371 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ADAM5Q6NVV9 412 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 LINGO2Q7L985 606 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 LYPD6Q86Y78 171 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 UBE2J2Q8N2K1 259 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF611Q8N823 705 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 DUSP18Q8NEJ0 188 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 CRLF2Q9HC73 371 aa15□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1B0GVI7 797 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1W2PR80 420 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SULT1B1O43704 296 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SOD3P08294 240 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 FOSL1P15407 271 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 PTH2RP49190 550 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 FAPQ12884 760 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 PPA1Q15181 289 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF529Q6P280 563 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SLC25A28Q96A46 364 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 FGGYQ96C11 551 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 FBXO17Q96EF6 278 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OR5H1A6NKK0 313 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 IGLV3-1P01715 115 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 CD3EP07766 207 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 DDOSTP39656 456 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 DGCR2P98153 550 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SLC36A2Q495M3 483 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 LRRC18Q8N456 261 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ENKURQ8TC29 256 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 GSX2Q9BZM3 304 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 GPR35Q9HC97 309 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 DANCRP0C864 163 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SLC2A1P11166 492 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 PAX1P15863 534 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 GABRA6Q16445 453 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 C18orf12Q96KH6 178 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 Q96MF0 132 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SHISA9B4DS77 424 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 APOC1P02654 83 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ANOS1P23352 680 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 CDK2P24941 298 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 POU3F4P49335 361 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 GPR176Q14439 515 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms