RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 WDYHV1Q96HA8 205 aa9.3□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.3□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 OR2H1Q9GZK4 316 aa9.3□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 CST11Q9H112 138 aa9.3□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 KLK11Q9UBX7 282 aa9.3□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.3□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 OSGIN2Q9Y236 505 aa9.3□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9.3□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 A6NIN4 97 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 AHRRA9YTQ3 701 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF587BE7ETH6 402 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 F5H5K5 113 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 RAB27BO00194 218 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 SSX4O60224 188 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 AGFG2O95081 481 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 NDUFB6O95139 128 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 TUBG1P23258 451 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 MAB21L1Q13394 359 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 MEF2DQ14814 521 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 GSG1Q2KHT4 349 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 TBRG1Q3YBR2 411 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 ASCL4Q6XD76 172 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 OR5AS1Q8N127 324 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 UBE2J2Q8N2K1 259 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 LRRC18Q8N456 261 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 OR52N4Q8NGI2 321 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 AQP3Q92482 292 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 APH1AQ96BI3 265 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 UPRTQ96BW1 309 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 SEH1LQ96EE3 360 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 CHST5Q9GZS9 411 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 LDAHQ9H6V9 325 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 NOX3Q9HBY0 568 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 ALG5Q9Y673 324 aa9.29□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 GTF3C1Q12789 2109 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1B0GUH1 482 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 AQP7O14520 342 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 AKR7A2O43488 359 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 ZG16O60844 167 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 C1QBP02746 253 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 CD74P04233 296 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 VSIG8P0DPA2 414 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF32P17041 273 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 NAT1P18440 290 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 STOMP27105 288 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 PMELP40967 661 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 PTGFRP43088 359 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 KISS1Q15726 138 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 ZFP69Q49AA0 526 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 OTPQ5XKR4 325 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM42Q69YG0 159 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 SKA3Q8IX90 412 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 OR4D6Q8NGJ1 314 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 RELTQ969Z4 430 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 SARAFQ96BY9 339 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 RADILQ96JH8 1075 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 HYLS1Q96M11 299 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 S100A13Q99584 98 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 MED28Q9H204 178 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF224Q9NZL3 707 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 ING4Q9UNL4 249 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 APCP25054 2843 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 MPDZO75970 2070 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF407Q9C0G0 2248 aa9.28□□□□□ -0.92
CDCA3-201ENST00000229265 A0A0A6YYJ9 748 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 OR14I1A6ND48 311 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 C19orf84I3L1E1 186 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 CYB5AP00167 134 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ABOP16442 354 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 MPGP29372 298 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 SLC6A9P48067 706 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 FUT6P51993 359 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 ADORA2A-AS1P86434 159 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 TGFBR3Q03167 851 aa9.27□□□□□ -0.93
CDCA3-201ENST00000229265 PLP2Q04941 152 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms