RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641487.1

CASC19-233, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 966 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-233	ENST00000641487	STOM	P27105	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ACVR1B	P36896	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	OR3A2	P47893	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	KCNJ3	P48549	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	EFNB2	P52799	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	SLURP1	P55000	103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	FOXA1	P55317	472 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ISL1	P61371	349 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	VLDLR	P98155	873 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	GK3P	Q14409	553 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	HNF4G	Q14541	408 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	VAMP3	Q15836	100 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	PPCDC	Q96CD2	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	MUCL1	Q96DR8	90 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	RITA1	Q96K30	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	STAC	Q99469	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	PIGU	Q9H490	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ABCA1	O95477	2261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487		A0A096LNT2	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF724	A8MTY0	619 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	NTN1	O95631	604 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	NUDT14	O95848	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	CD8A	P01732	235 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	FGF2	P09038	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	CSF3	P09919	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	MYL2	P10916	166 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	GGT1	P19440	569 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	COX5A	P20674	150 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	NR4A1	P22736	598 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	FHIT	P49789	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	P2RX1	P51575	399 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	CDH11	P55287	796 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	DNAJB13	P59910	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF117	Q03924	483 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	FOXF1	Q12946	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	RAB35	Q15286	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	CD226	Q15762	336 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	DUSP5	Q16690	384 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-233	ENST00000641487	NATD1	Q8N6N6	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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