RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	AMELY	Q99218	206 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	PPA2	Q9H2U2	334 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0G2JK05	382 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1B0GVI7	797 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	FAM183A	A6NL82	134 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF878	C9JN71	531 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	XRCC2	O43543	280 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	SPI1	P17947	270 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	HSD11B1	P28845	292 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	GRK5	P34947	590 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	MZT1	Q08AG7	82 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	OCLN	Q16625	522 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL12	Q53G59	568 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078		Q8N7P7	452 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	CD300A	Q9UGN4	299 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	KPTN	Q9Y664	436 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078		U3KQV3	271 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	MEIOC	A2RUB1	952 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	NPFF	O15130	113 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	AKR7A2	O43488	359 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	POU1F1	P28069	291 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	GSK3A	P49840	483 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	LY6E	Q16553	131 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	C17orf50	Q8WW18	174 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	PIGC	Q92535	297 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	SPSB4	Q96A44	273 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	PGAM5	Q96HS1	289 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	ABHD6	Q9BV23	337 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	VNN3	Q9NY84	501 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	IL20	Q9NYY1	176 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	BTBD17	A6NE02	478 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	CCNB2	O95067	398 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	PAH	P00439	452 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	FBP1	P09467	338 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	HSD17B1	P14061	328 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFB7	P17568	137 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	PRDX6	P30041	224 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	SAA4	P35542	130 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	GNAL	P38405	381 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	DDOST	P39656	456 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	SLC15A1	P46059	708 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	GABRA2	P47869	451 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	TGM4	P49221	684 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	DGUOK	Q16854	277 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	RORB	Q92753	470 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PQ09	198 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078		G3V4G9	280 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TCF4-262	ENST00000628078	KRT36	O76013	467 aa		11.05	□□□□□ -0.64

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