RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627212.2

RAPGEF6-215, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 4,694 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-215ENST00000627212 CTLA4P16410 223 aa8.96□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC6A1P30531 599 aa8.96□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF85Q03923 595 aa8.96□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 MIDNQ504T8 468 aa8.96□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF787Q6DD87 383 aa8.96□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR2T2Q6IF00 324 aa8.96□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.96□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 TNFSF11O14788 317 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 TAAR5O14804 337 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPINT2O43291 252 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR10J4P0C629 311 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 BMP5P22003 454 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF79Q15937 498 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC35G3Q8N808 338 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 FAM60AQ9NP50 221 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 GPR31O00270 319 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 B3GALNT1O75752 331 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 NKX2-2O95096 273 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 SFTA3P0C7M3 94 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR8U8P0C7N1 319 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 MPGP29372 298 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF117Q03924 483 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 FAM53BQ14153 422 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC10A1Q14973 349 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZAR1Q86SH2 424 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 PTP4A1Q93096 173 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 RAB9BQ9NP90 201 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 NTMQ9P121 344 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 CTAG2O75638 210 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 CER1O95813 267 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 DAOP14920 347 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ABCD3P28288 659 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 PNLIPRP2P54317 469 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR2A5Q96R48 311 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A1W2PPC4 97 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 VAMP5O95183 116 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRASP01116 189 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ECI1P42126 302 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 CLDN15P56746 228 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF90Q03938 601 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 RNF151Q2KHN1 245 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF626Q68DY1 528 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ST8SIA1Q92185 356 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 MENTQ9BUN1 341 aa8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 SIGLEC5O15389 551 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 IL5P05113 134 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 SIGLEC14Q08ET2 396 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 NUBPLQ8TB37 319 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ISOC2Q96AB3 205 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 OBP2AQ9NY56 170 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 H0YIG0 161 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 MASP2O00187 686 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 SCGB2A1O75556 95 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 GLAP06280 429 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC25A4P12235 298 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 MYBPHQ13203 477 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 GPX8Q8TED1 209 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 HLA-CQ95604 372 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 OXGR1Q96P68 337 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 FAAP24Q9BTP7 215 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 BTAF1O14981 1849 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ADAM10O14672 748 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR8G1Q15617 311 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 GUK1Q16774 197 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM104Q8NE00 496 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRRX2Q99811 253 aa8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.5 ms