RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF511Q8NB15 262 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52L1Q8NGH7 329 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8D4Q8NGM9 314 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 DCTN5Q9BTE1 182 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFB3O43676 98 aa21.01■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR9Q2Q8NGE9 314 aa21■□□□□ 0.95
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5T2Q8NGG2 359 aa21■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 MCUR1Q96AQ8 359 aa21■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 PPA2Q9H2U2 334 aa21■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 CRMP1Q14194 572 aa20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-211ENST00000590874 TIGD6Q17RP2 521 aa20.99■□□□□ 0.95
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa20.99■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 CD300AQ9UGN4 299 aa20.99■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-211ENST00000590874 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 HAO2Q9NYQ3 351 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF319Q9P2F9 582 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLEC9Q9Y336 463 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.96■□□□□ 0.95
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CAPNS1-211ENST00000590874 HSD11B1P28845 292 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 GNALP38405 381 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A1P53007 311 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 HERPUD1Q15011 391 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 FBLN7Q53RD9 439 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF788Q6ZQV5 615 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R35Q8TAP8 253 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf50Q8WW18 174 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
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