RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM157BP0CG42 384 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf100Q5SVJ3 147 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM108Q6UXF1 575 aa26.72■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 OR5AS1Q8N127 324 aa26.72■■□□□ 1.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 SSC4DQ8WTU2 575 aa26.69■■□□□ 1.86
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CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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CAPNS1-206ENST00000588815 CADP27708 2225 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX2-6A6NCS4 301 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFSF8P32971 234 aa26.67■■□□□ 1.86
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CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-206ENST00000588815 IQCF6A8MYZ5 107 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 PAHP00439 452 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 GLRXP35754 106 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS12P56730 875 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA46Q5T0L3 261 aa26.65■■□□□ 1.86
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