RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587215.1

PKN1-209, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 363 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-209	ENST00000587215	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215	WDR82	Q6UXN9	313 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215		Q6YL49	198 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215	FGFRL1	Q8N441	504 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215	LRRC29	Q8WV35	223 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215	SEH1L	Q96EE3	360 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-209	ENST00000587215		A0A1B0GW55	424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	GNGT2	O14610	69 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	CDIPT	O14735	213 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	SELENOF	O60613	162 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	LYN	P07948	512 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	OSM	P13725	252 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	AMY2B	P19961	511 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	PRKACG	P22612	351 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	CPO	Q8IVL8	374 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	ITPKC	Q96DU7	683 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	CCL13	Q99616	98 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	NOX4	Q9NPH5	578 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	DUX4	Q9UBX2	424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	TIPRL	O75663	272 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	HMGN1	P05114	100 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	OMG	P23515	440 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	ACKR3	P25106	362 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	MICB	Q29980	383 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	LYZL4	Q96KX0	146 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	RGCC	Q9H4X1	137 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	PRODH	O43272	600 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	MELTF	P08582	738 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	SLC2A5	P22732	501 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	TGM4	P49221	684 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	HCCS	P53701	268 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	PDCD1	Q15116	288 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	WDR38	Q5JTN6	314 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	LHX4	Q969G2	390 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	WIPF1	O43516	503 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	CST4	P01036	141 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	IGHV1-69	P01742	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	ANXA8	P13928	327 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	GNAL	P38405	381 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	PRDX4	Q13162	271 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-209	ENST00000587215	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22

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