RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR8S1Q8NH09 359 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.073e-10■■■■■ 88.3
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF799Q96GE5 643 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 MED30Q96HR3 178 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 RCHY1Q96PM5 261 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRR25Q96S07 402 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 BAG5Q9UL15 447 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 HERC2O95714 4834 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 SIGLEC5O15389 551 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 RAMP3O60896 148 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 RHBDL1O75783 438 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 CHATP28329 748 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPR4P46093 362 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 THBS3P49746 956 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL5RAQ01344 420 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 VMACQ2NL98 169 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZBED5Q49AG3 693 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 AGKQ53H12 422 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 EPGNQ6UW88 154 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR10A6Q8NH74 314 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 C19orf12Q9NSK7 152 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDNEP1-202ENST00000570380 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC18A1P54219 525 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 NFYCQ13952 458 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 SSX2Q16385 188 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRT71Q3SY84 523 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 DHDDSQ86SQ9 333 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 ADCK1Q86TW2 530 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR6V1Q8N148 313 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 MALSU1Q96EH3 234 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 LYZL4Q96KX0 146 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRRC1Q96M27 445 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 CGREF1Q99674 301 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF649Q9BS31 505 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 RHCGQ9UBD6 479 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 B9D1Q9UPM9 204 aa8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 SORL1Q92673 2214 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 PTP4A3O75365 173 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 TIPRLO75663 272 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 CRABP1P29762 137 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 DDOSTP39656 456 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 GABRA2P47869 451 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 DYNLT3P51808 116 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC25A1P53007 311 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRT77Q7Z794 578 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR52H1Q8NGJ2 320 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.32□□□□□ -1.08
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CTDNEP1-202ENST00000570380 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 SPTSSAQ969W0 71 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa8.32□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A087WUU8 490 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR2AT4A6NND4 320 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 J3KTA2 159 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 AKR7A2O43488 359 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 NDUFB2O95178 105 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARG1P05089 322 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC2A1P11166 492 aa8.31□□□□□ -1.08
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