RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	RTL6	Q6ICC9	239 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	FCRLA	Q7L513	359 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	FAM122B	Q7Z309	247 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	OR2T33	Q8NG76	320 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	OR4K13	Q8NH42	304 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	ABHD3	Q8WU67	409 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	APH1B	Q8WW43	257 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	WBP1	Q96G27	269 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	CNBD2	Q96M20	576 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	PITX2	Q99697	317 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	EMC6	Q9BV81	110 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	CDH20	Q9HBT6	801 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	AMBN	Q9NP70	447 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	FANCF	Q9NPI8	374 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	INIP	Q9NRY2	104 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	MED29	Q9NX70	200 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	RNF6	Q9Y252	685 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	MPDZ	O75970	2070 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	GTF3C1	Q12789	2109 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PRG6	482 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	SLC22A20	A6NK97	555 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	FAM183A	A6NL82	134 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF726	A6NNF4	738 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934		H7C1C5	153 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	DCTN6	O00399	190 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	SURF4	O15260	269 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF9	O43307	516 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	IDH3B	O43837	385 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	CYTIP	O60759	359 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	TOX	O94900	526 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	VAMP5	O95183	116 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	TXNDC12	O95881	172 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	CSN3	P07498	182 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	CLU	P10909	449 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	ACADS	P16219	412 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF43	P17038	809 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	EDNRA	P25101	427 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	PTAFR	P25105	342 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	FMO3	P31513	532 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	ACVR1B	P36896	505 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	SMS	P52788	366 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	BID	P55957	195 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	CLDN17	P56750	224 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	LCN6	P62502	163 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	IL5RA	Q01344	420 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	PUDP	Q08623	228 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	IL18R1	Q13478	541 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	MED21	Q13503	144 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	CRMP1	Q14194	572 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	SLC17A1	Q14916	467 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	PGGHG	Q32M88	737 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	MEST	Q5EB52	335 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	OTP	Q5XKR4	325 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	CASP12	Q6UXS9	341 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	MMD2	Q8IY49	270 aa		3.8	□□□□□ -1.8

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