RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556082.5

ATXN3-235, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-235ENST00000556082 MLANAQ16655 118 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF774Q6NX45 483 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SKA3Q8IX90 412 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 APH1AQ96BI3 265 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 MED30Q96HR3 178 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 LYZL4Q96KX0 146 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 CHST5Q9GZS9 411 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 GLRX2Q9NS18 164 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 KLK11Q9UBX7 282 aa7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 MED12Q93074 2177 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 E9PLN8 166 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 RAB27BO00194 218 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 AQP7O14520 342 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 PRAF2O60831 178 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 LPLP06858 475 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 NAT2P11245 290 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 B4GALT1P15291 398 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 GIFP27352 417 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ARR3P36575 388 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SLC6A9P48067 706 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ACTBP60709 375 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ACTG1P63261 375 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 PMPCAQ10713 525 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 CARTPTQ16568 116 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 NAA40Q86UY6 237 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 AQP3Q92482 292 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 FAM46BQ96A09 425 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SPSB4Q96A44 273 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SEH1LQ96EE3 360 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 TECTBQ96PL2 329 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 GHITMQ9H3K2 345 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 LDAHQ9H6V9 325 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 NEK6Q9HC98 313 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF221Q9UK13 617 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ALG5Q9Y673 324 aa7.22□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 DMDP11532 3685 aa7.21□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 C5orf63A6NC05 138 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 SLC22A20A6NK97 555 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 KDM4BO94953 1096 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 DBHP09172 617 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 PRKACBP22694 351 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 ANOS1P23352 680 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 UNC119Q13432 240 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM42Q69YG0 159 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 COMMD2Q86X83 199 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 SPSB1Q96BD6 273 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 SOX7Q9BT81 388 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.21□□□□□ -1.26
ATXN3-235ENST00000556082 CALHM2Q9HA72 323 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms