RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550379.1

RNF41-208, Transcript of ring finger protein 41, human

TSL 3

Gene RNF41, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF41-208	ENST00000550379	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	CENPO	Q9BU64	300 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	OR51E2	Q9H255	320 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	CA10	Q9NS85	328 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	CKLF	Q9UBR5	152 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	GHRL	Q9UBU3	117 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	GPR160	Q9UJ42	338 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	DHDH	Q9UQ10	334 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RNF41-208	ENST00000550379	SPG11	Q96JI7	2443 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		A0A1W2PR80	420 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	C5orf63	A6NC05	138 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	NOTO	A8MTQ0	251 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		M0R1B8	84 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	P2RY10	O00398	339 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ABCD4	O14678	606 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PDCD5	O14737	125 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SULT1B1	O43704	296 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CD55	P08174	381 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SLC2A1	P11166	492 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	NAT2	P11245	290 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	GATA4	P43694	442 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MMP15	P51511	669 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SELENOV	P59797	346 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MZT1	Q08AG7	82 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RDH10	Q8IZV5	341 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM203	Q969S6	136 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ERGIC1	Q969X5	290 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CMBL	Q96DG6	245 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ITPKC	Q96DU7	683 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TMED9	Q9BVK6	235 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SLITRK2	Q9H156	845 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PLK3	Q9H4B4	646 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	NOX4	Q9NPH5	578 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CMAHP	Q9Y471	501 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		A0A0G2JK05	382 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SHISA3	A0PJX4	238 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM210	A6NLX4	147 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		A6NNC1	897 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		B9A039	149 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	IFNL4	K9M1U5	179 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	AIP	O00170	330 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SLC17A2	O00624	439 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TBX1	O43435	398 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	NRAS	P01111	189 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CCL2	P13500	99 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ADRA2C	P18825	462 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ATF1	P18846	271 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RAB3A	P20336	220 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MYL9	P24844	172 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MPZ	P25189	248 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	GCH1	P30793	250 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CD200	P41217	278 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FUT6	P51993	359 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ADIPOQ	Q15848	244 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM189A2	Q15884	450 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	C22orf42	Q6IC83	251 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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