RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 DHRS3O75911 302 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CST4P01036 141 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 IGHV4-39P01824 125 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 MT-ND2P03891 347 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCL1P22362 96 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 GNALP38405 381 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ART1P52961 327 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMBIM6P55061 237 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 TAS2R43P59537 309 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCL8P80075 99 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 MZT1Q08AG7 82 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 TNK1Q13470 666 aa9.56□□□□□ -0.88
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.56□□□□□ -0.88
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TRAPPC4-211ENST00000533012 SPERTQ8NA61 448 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR5AK2Q8NH90 309 aa9.56□□□□□ -0.88
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TRAPPC4-211ENST00000533012 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.56□□□□□ -0.88
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TRAPPC4-211ENST00000533012 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 SOX7Q9BT81 388 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 IL19Q9UHD0 177 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 HHLA2Q9UM44 414 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 V9GYS6 101 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CACNA1DQ01668 2161 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 A0A1B0GWJ7 208 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 H0YL77 283 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 H3BSH0 61 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZFPL1O95159 310 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 SERPINA3P01011 423 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 HPXP02790 462 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 HLA-DPB1P04440 258 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CD55P08174 381 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 DAOP14920 347 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 TNFRSF1AP19438 455 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ACHEP22303 614 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ACKR3P25106 362 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDH15P55291 814 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 DSCR9P59020 149 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ACSM1Q08AH1 577 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDK5R1Q15078 307 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPHARQ15513 63 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 MED22Q15528 200 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 SHEQ5VZ18 495 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 Q6ZSR3 168 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR10AD1Q8NGE0 317 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR8S1Q8NH09 359 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 RDH5Q92781 318 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa9.55□□□□□ -0.88
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TRAPPC4-211ENST00000533012 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ABCB9Q9NP78 766 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ITPR2Q14571 2701 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF850A8MQ14 1090 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 F5H5P2 479 aa9.54□□□□□ -0.88
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TRAPPC4-211ENST00000533012 LY6HO94772 140 aa9.54□□□□□ -0.88
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TRAPPC4-211ENST00000533012 CELP19835 753 aa9.54□□□□□ -0.88
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TRAPPC4-211ENST00000533012 BDH1Q02338 343 aa9.54□□□□□ -0.88
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TRAPPC4-211ENST00000533012 LSAMPQ13449 338 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 TESK1Q15569 626 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 NEDD8Q15843 81 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 XAF1Q6GPH4 301 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 MOB3CQ70IA8 216 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 KRT74Q7RTS7 529 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 GHSRQ92847 366 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 C10orf35Q96D05 121 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 SMIM19Q96E16 107 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR2V2Q96R30 315 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR5M11Q96RB7 305 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC4-211ENST00000533012 MICU1Q9BPX6 476 aa9.54□□□□□ -0.88
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