RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 TGFBR3Q03167 851 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 PLP2Q04941 152 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 GSG1Q2KHT4 349 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 UTS2BQ765I0 119 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 POM121L2Q96KW2 1035 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 WDR1O75083 606 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 TNFSF13O75888 250 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 CCNOP22674 350 aa22.6■■□□□ 1.21
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HOXB3-212ENST00000498678 INPP1P49441 399 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF92Q03936 586 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 UBE2V2Q15819 145 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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HOXB3-212ENST00000498678 FAM215AQ9Y5M1 114 aa22.6■■□□□ 1.21
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HOXB3-212ENST00000498678 DMRTC1Q5HYR2 192 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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HOXB3-212ENST00000498678 SLC22A4Q9H015 551 aa22.59■■□□□ 1.21
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HOXB3-212ENST00000498678 XRCC2O43543 280 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 TOXO94900 526 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 HCKP08631 526 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 CD3GP09693 182 aa22.59■■□□□ 1.21
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HOXB3-212ENST00000498678 CD163Q86VB7 1156 aa22.59■■□□□ 1.21
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HOXB3-212ENST00000498678 ZNF75AQ96N20 296 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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HOXB3-212ENST00000498678 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa22.58■■□□□ 1.21
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HOXB3-212ENST00000498678 FAM87AP0C7U9 286 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 MAP2K3P46734 347 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 PER3P56645 1201 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 PRSS12P56730 875 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 FAM3AP98173 230 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 OR10K2Q6IF99 312 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 MDP1Q86V88 176 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-212ENST00000498678 CIB4A0PJX0 185 aa22.57■■□□□ 1.2
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HOXB3-212ENST00000498678 MTFR2Q6P444 385 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 ANGPTL5Q86XS5 388 aa22.57■■□□□ 1.2
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HOXB3-212ENST00000498678 MS4A3Q96HJ5 214 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 ATG5Q9H1Y0 275 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 SLA2Q9H6Q3 261 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 GGT3PA6NGU5 568 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 FIGNL2A6NMB9 653 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 KDM4BO94953 1096 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 CGAP01215 116 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 GSK3AP49840 483 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 GABRA6Q16445 453 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 C1orf185Q5T7R7 199 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 HACD4Q5VWC8 232 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 FAM57AQ8TBR7 257 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 AUNIPQ9H7T9 357 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 NPAP1Q9NZP6 1156 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 SHOXO15266 292 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 LYRM1O43325 122 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 BPNT1O95861 308 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 TDGF1P3P51864 188 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 QRFPP83859 136 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 CRIP3Q6Q6R5 217 aa22.56■■□□□ 1.2
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HOXB3-212ENST00000498678 PTHLHP12272 177 aa22.56■■□□□ 1.2
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HOXB3-212ENST00000498678 LINC00303Q3SY05 128 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 FAM122CQ6P4D5 195 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 LURAP1LQ8IV03 231 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 GABRG1Q8N1C3 465 aa22.56■■□□□ 1.2
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HOXB3-212ENST00000498678 NPRL2Q8WTW4 380 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 GABARAPH6UMI1 98 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 SERPINA5P05154 406 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 VSIG8P0DPA2 414 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 RAB6AP20340 208 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 OR3A4PP47883 348 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 SRP9P49458 86 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 AWAT2Q6E213 333 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC36Q8IYA8 594 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 C15orf40Q8WUR7 153 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-212ENST00000498678 PROCRQ9UNN8 238 aa22.55■■□□□ 1.2
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