RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	GNAL	P38405	381 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PITPNB	P48739	271 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	NPY4R	P50391	375 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	HCCS	P53701	268 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	IL5RA	Q01344	420 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	KRT74	Q7RTS7	529 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ITPKC	Q96DU7	683 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	LYZL4	Q96KX0	146 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	MRI1	Q9BV20	369 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	OCEL1	Q9H607	264 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	CLN8	Q9UBY8	286 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	AUP1	Q9Y679	476 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	OOEP	A6NGQ2	149 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327		H3BNX3	289 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	NDUFA2	O43678	99 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	CST4	P01036	141 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	LHB	P01229	141 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	GRP	P07492	148 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ATP6V1B1	P15313	513 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	CD80	P33681	288 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	HILS1	P60008	231 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PAX8	Q06710	450 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	MICU1	Q9BPX6	476 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	CLN6	Q9NWW5	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM210	A6NLX4	147 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PSMD9	O00233	223 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	VENTX	O95231	258 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ALPL	P05186	524 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	CFHR2	P36980	270 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	CXCR4	P61073	352 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	EGR3	Q06889	387 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	POU4F2	Q12837	409 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PRDX4	Q13162	271 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	WDR82	Q6UXN9	313 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PKP2	Q99959	881 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	USE1	Q9NZ43	259 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	SRRM5	B3KS81	715 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	C3orf80	F5H4A9	247 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	EGR1	P18146	543 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	HTR1F	P30939	366 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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