RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	TRAM1	Q15629	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	INA	Q16352	499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	MED12	Q93074	2177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	NTNG2	Q96CW9	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	WDR54	Q9H977	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A1W2PQ72	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ISPD	A4D126	451 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262		B4DXG7	233 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	GABRP	O00591	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RNF13	O43567	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SCO2	O43819	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	UPK1B	O75841	260 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SC5D	O75845	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CDRT1	O95170	752 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SNX4	O95219	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	IGHM	P01871	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	S100A5	P33763	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	AQP2	P41181	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PTGDS	P41222	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RORC	P51449	518 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CCR4	P51679	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TAS2R43	P59537	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	HERV-K104	P61576	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	HSF2	Q03933	536 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZP4	Q12836	540 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OPCML	Q14982	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OXA1L	Q15070	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	GRINA	Q7Z429	371 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MARCH3	Q86UD3	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2T27	Q8NH04	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF563	Q8TA94	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms