RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 OR6V1Q8N148 313 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 MUC7Q8TAX7 377 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 FANK1Q8TC84 345 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 SLCO4A1Q96BD0 722 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 C7orf34Q96L11 122 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 NMNAT3Q96T66 252 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 PITX2Q99697 317 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 ATF6BQ99941 703 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 FUZQ9BT04 418 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 WNT10AQ9GZT5 417 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-222ENST00000491867 NDUFAB1O14561 156 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ARPC3O15145 178 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 DIRAS1O95057 198 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 LHBP01229 141 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 NUDT2P50583 147 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CD83Q01151 205 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 MALLQ13021 153 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 IKZF1Q13422 519 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 MICBQ29980 383 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 HACD2Q6Y1H2 254 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 FAM86B1Q8N7N1 296 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 OR52J3Q8NH60 311 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 C8orf46Q8TAG6 207 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 PIFOQ8TCI5 191 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 DPF1Q92782 380 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CHID1Q9BWS9 393 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CDCA4Q9BXL8 241 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SLC22A4Q9H015 551 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 EFCAB1Q9HAE3 211 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 INPP5EQ9NRR6 644 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ABCD2Q9UBJ2 740 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 NDUFB3O43676 98 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ANGPTL7O43827 346 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 GMDSO60547 372 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 RENP00797 406 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 LCATP04180 440 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 LMO1P25800 156 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SLC6A6P31641 620 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 GGT2P36268 569 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 PCK2Q16822 640 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 RFX4Q33E94 735 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SLC36A3Q495N2 470 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 HCP5Q6MZN7 132 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 PGAP1Q75T13 922 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 NAA40Q86UY6 237 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ZBTB46Q86UZ6 589 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 OR52D1Q9H346 318 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CD300LBA8K4G0 201 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 M0R135 149 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 M0R1W7 72 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ACOT8O14734 319 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CHRM2P08172 466 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SELLP14151 372 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 TPTEP56180 551 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 KRT72Q14CN4 511 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 LRRC10Q5BKY1 277 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 OR5AU1Q8NGC0 362 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 OR4K13Q8NH42 304 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SEH1LQ96EE3 360 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF799Q96GE5 643 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 MAP6Q96JE9 813 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 IFT27Q9BW83 186 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 PRSS22Q9GZN4 317 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 FN3KQ9H479 309 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 OR6C68A6NDL8 312 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC22O60826 627 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 HLA-DQA2P01906 255 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 NOS3P29474 1203 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 TGM4P49221 684 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 PSME3P61289 254 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 GLYATQ6IB77 296 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms