RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2E1P51965 193 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf54Q08AI8 447 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF695Q8IW36 515 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC39Q96DD0 335 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 RNF170Q96K19 258 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2E2Q96LR5 201 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 SULT4A1Q9BR01 284 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 MYO10Q9HD67 2058 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01619G3V211 115 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 H7C2Y5 167 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFS8O00217 210 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 MYL12BO14950 172 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 MT-ND4P03905 459 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 IL1RNP18510 177 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ERFP50548 548 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLEC14Q08ET2 396 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 CPTPQ5TA50 214 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP1Q6P2D0 407 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf87Q6PH81 154 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 OPN5Q6U736 354 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 OR1S1Q8NH92 325 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01560Q8TB33 94 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 L3HYPDHQ96EM0 354 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 KCNS3Q9BQ31 491 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 SFXN3Q9BWM7 321 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 WFDC1Q9HC57 220 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 OR5H1A6NKK0 313 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 MANBAO00462 879 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CD74P04233 296 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 IVLP07476 585 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00869P0C866 280 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 NPY1RP25929 384 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 KIR3DL2P43630 455 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ETV1P50549 477 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 YIF1BQ5BJH7 314 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 AADACL4Q5VUY2 407 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 STEAP4Q687X5 459 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 GUSBP11Q6P575 273 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TTLQ8NG68 377 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 OR9A2Q8NGT5 310 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 DCAKDQ8WVC6 231 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM234Q8WY98 164 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CDS1Q92903 461 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SPIN2AQ99865 258 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SIKE1Q9BRV8 207 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 NECAP2Q9NVZ3 263 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLEC9Q9Y336 463 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ARID1AO14497 2285 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 PCM1Q15154 2024 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf63A6NC05 138 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 E7EWF7 191 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 PSPHP1O15172 72 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 GMDSO60547 372 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC6AO75865 159 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35G6P0C7Q6 338 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ME2P23368 584 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ARR3P36575 388 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 HCCSP53701 268 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35A1P78382 337 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 VAMP3Q15836 100 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD14CQ5VZR4 134 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 OR4M1Q8NGD0 313 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 DOK1Q99704 481 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CHID1Q9BWS9 393 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 CFL2Q9Y281 166 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 STK38LQ9Y2H1 464 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0A6YYD5 115 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 FAM25EA8MYX2 175 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV12-3P01733 135 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 RHOCP08134 193 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ABCA11PQ4W5N1 156 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF461Q8TAF7 563 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 ENKURQ8TC29 256 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 RXFP2Q8WXD0 754 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A46Q96AG3 418 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 KCNS1Q96KK3 526 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-212ENST00000491302 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.63□□□□□ -1.67
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