RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	DOK3	Q7L591	496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	EXO5	Q9H790	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		V9GYS6	101 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	MPDZ	O75970	2070 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GVC2	190 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247		H7C417	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ORC5	O43913	435 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAPPC6A	O75865	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT33A	O76009	404 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MAS1	P04201	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MELTF	P08582	738 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	UBB	P0CG47	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	COX5B	P10606	129 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GYPE	P15421	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	BDKRB2	P30411	391 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	THBS4	P35443	961 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CX3CR1	P49238	355 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFSF10	P50591	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN12	P56749	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PCBD1	P61457	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	DRAM2	Q6UX65	266 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	BIVM	Q86UB2	503 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC7A6	Q92536	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	HES7	Q9BYE0	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP28	Q9H239	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RGCC	Q9H4X1	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR84	Q9NQS5	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	DIABLO	Q9NR28	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms