RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488352.2

DMTF1-223, Transcript of cyclin D binding myb like transcription factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene DMTF1, Length 2,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMTF1-223	ENST00000488352	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	DOK1	Q99704	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	CA10	Q9NS85	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352		E7EQL1	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	GLCE	O94923	617 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	CD79A	P11912	226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	MYF6	P23409	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	FMO3	P31513	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	RANBP1	P43487	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ZNF83	P51522	516 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ART1	P52961	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	UCP2	P55851	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	GGTLC2	Q14390	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	PGGHG	Q32M88	737 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	DRAM2	Q6UX65	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	KLK2	P20151	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	STOM	P27105	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	GPR4	P46093	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	TMEM33	P57088	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352		Q5PR19	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352		G3V2T6	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352		H0YJX3	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	XRCC2	O43543	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	SGCE	O43556	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	NDUFS7	O75251	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	CD99	P14209	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ZNF12	P17014	697 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	CHAT	P28329	748 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	BDKRB2	P30411	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ENTPD1	P49961	510 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	NPY4R	P50391	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	CRISP1	P54107	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ERVK-25	P63136	954 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DMTF1-223	ENST00000488352	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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