RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 OR5D16Q8NGK9 328 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 DDIT4LQ96D03 193 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 OR2V2Q96R30 315 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 SDF2Q99470 211 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 LITAFQ99732 161 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 ACPTQ9BZG2 426 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 BCL2L14Q9BZR8 327 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 PIGUQ9H490 435 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 RHOJQ9H4E5 214 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 POPDC3Q9HBV1 291 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 TAS2R7Q9NYW3 318 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 VPS29Q9UBQ0 182 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 POFUT2Q9Y2G5 429 aa3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 ZNF208O43345 1280 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 TPPPO94811 219 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 UBL3O95164 117 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 C1QCP02747 245 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 GPIP06744 558 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 H1F0P07305 194 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 PNMTP11086 282 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 GFAPP14136 432 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 SELLP14151 372 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 GABRB1P18505 474 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 CBLP22681 906 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 CNTFRP26992 372 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 RAB25P57735 213 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 MOGQ16653 247 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 LCE3AQ5TA76 89 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 SEL1L2Q5TEA6 688 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 EGFL6Q8IUX8 553 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 FCAMRQ8WWV6 532 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 MS4A4EQ96PG1 132 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 BPIFA3Q9BQP9 254 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 RMND5AQ9H871 391 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 ONECUT1Q9UBC0 465 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 FBXL17Q9UF56 701 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 PCTPQ9UKL6 214 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CNN3-206ENST00000487539 A6NDX4 124 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 DUXAA6NLW8 204 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 F5H5P2 479 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 GLRA3O75311 464 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 BRI3O95415 125 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 SNAP29O95721 258 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 CLIC3O95833 236 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 TSHBP01222 138 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 STMN1P16949 149 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 ZNF43P17038 809 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 PPP1CBP62140 327 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 TBC1D28Q2M2D7 210 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 DEFB136Q30KP8 78 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 GGTA1PQ4G0N0 100 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 XKR7Q5GH72 579 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 AP1ARQ63HQ0 302 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 KLC3Q6P597 504 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 OR5AS1Q8N127 324 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 OR51G2Q8NGK0 314 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 LRR1Q96L50 414 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 OXGR1Q96P68 337 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 OR7D2Q96RA2 312 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 KCNA7Q96RP8 456 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 STACQ99469 402 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 GPR22Q99680 433 aa3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CNN3-206ENST00000487539 NMRAL1Q9HBL8 299 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms