RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 CTLA4P16410 223 aa11.97□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 CD226Q15762 336 aa11.97□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 OSR2Q8N2R0 312 aa11.97□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.97□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 C4orf45Q96LM5 186 aa11.97□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PR80 420 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 H3BMH7 237 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 TGM6O95932 706 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 HPNP05981 417 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 NAT1P18440 290 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 GPR12P47775 334 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 GABRA4P48169 554 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 FUT6P51993 359 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 PLK3Q9H4B4 646 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 PLSCR3Q9NRY6 295 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 IGHV4-34P06331 123 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 UBE2KP61086 200 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 SVBPQ8N300 66 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 OR2AK2Q8NG84 335 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 UHRF2Q96PU4 802 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-241ENST00000487169 CADP27708 2225 aa11.96□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.96□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 YIF1AO95070 293 aa11.96□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 S100A7P31151 101 aa11.96□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 C21orf58P58505 322 aa11.96□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 IFITM2Q01629 132 aa11.96□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 DEGS2Q6QHC5 323 aa11.96□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa11.96□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.96□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 EDARQ9UNE0 448 aa11.96□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 HRKO00198 91 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GABRB1P18505 474 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF626Q68DY1 528 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SPINK14Q6IE38 97 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SARGQ9BW04 601 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GNG3P63215 75 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FXNQ16595 210 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 BAK1Q16611 211 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM268Q5VZI3 342 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR2T2Q6IF00 324 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR8D4Q8NGM9 314 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR10X1Q8NGY0 326 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 NANPQ8TBE9 248 aa11.95□□□□□ -0.5
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HDLBP-241ENST00000487169 SPSB1Q96BD6 273 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 C19orf12Q9NSK7 152 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 HIF1ANQ9NWT6 349 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1B0GTH9 108 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CYR61O00622 381 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PATE4P0C8F1 98 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CT45A6P0DMU7 189 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CT45A5P0DMU8 189 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CT45A7P0DMV0 189 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CT45A8P0DMV1 189 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CT45A9P0DMV2 189 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ATF1P18846 271 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TBPP20226 339 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 THBS4P35443 961 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RPL35P42766 123 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RPS10P46783 165 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM21Q3B7S5 101 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CT45A1Q5HYN5 189 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FAM209AQ5JX71 171 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CT45A3Q8NHU0 189 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CT55Q8WUE5 264 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 MCHR2Q969V1 340 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GSX2Q9BZM3 304 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RNF150Q9ULK6 438 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PTPRFP10586 1907 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 IGHA2P01877 340 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GSK3AP49840 483 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ABCD4O14678 606 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 XRCC3O43542 346 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SPRY3O43610 288 aa11.94□□□□□ -0.5
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