RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 S100A13Q99584 98 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 STUB1Q9UNE7 303 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 V9GYS6 101 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 OR5B21A6NL26 309 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM210A6NLX4 147 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 PRR32B1ATL7 298 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 E9PI62 339 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 PLAUP00749 431 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CD36P16671 472 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 PCMT1P22061 227 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 KIR3DL2P43630 455 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CAPZA1P52907 286 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 DOC2BQ14184 412 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 TESK1Q15569 626 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 DTX2Q86UW9 622 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF573Q86YE8 665 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 OR5AS1Q8N127 324 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 MUL1Q969V5 352 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SPSB1Q96BD6 273 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 FGGYQ96C11 551 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 BORCS8Q96FH0 119 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 OPALINQ96PE5 141 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 IL19Q9UHD0 177 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 FZR1Q9UM11 496 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 C17orf100A8MU93 164 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SIAH2O43255 324 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SPRY3O43610 288 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 INMTO95050 263 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ALX3O95076 343 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 HCKP08631 526 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ADRA2AP08913 450 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CA6P23280 308 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 TGFBR2P37173 567 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 MPV17P39210 176 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SOX2P48431 317 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 RBP2P50120 134 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 FUT6P51993 359 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ATP1B3P54709 279 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ERVS71-1P61550 626 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 GNG3P63215 75 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 PRDX4Q13162 271 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 MOB3CQ70IA8 216 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 UTS2BQ765I0 119 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SGCDQ92629 289 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 NINJ1Q92982 152 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM203Q969S6 136 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 RNF170Q96K19 258 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 GPER1Q99527 375 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SLC30A2Q9BRI3 323 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CHST5Q9GZS9 411 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 FLNCQ14315 2725 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1B0GTI1 187 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 H7C417 338 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 SULT1B1O43704 296 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms