RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 GATA4P43694 442 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 TP53I3Q53FA7 332 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 LIPNQ5VXI9 398 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 POM121Q96HA1 1249 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF391Q9UJN7 358 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 OR52A1Q9UKL2 312 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM157AC9JC47 383 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 BCL2L15Q5TBC7 163 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 COMMD2Q86X83 199 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 MOB1AQ9H8S9 216 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC22A13Q9Y226 551 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 XPNPEP2O43895 674 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF205O95201 554 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 CDH15P55291 814 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ACTC1P68032 377 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ACTA1P68133 377 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 RORBQ92753 470 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 C1orf159Q96HA4 380 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 GAL3ST1Q99999 423 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF665Q9H7R5 613 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ACOXLQ9NUZ1 547 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 GNG8Q9UK08 70 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 SNX5Q9Y5X3 404 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 DAPL1A0PJW8 107 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 A8MV72 311 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 DENRO43583 198 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM20BO75063 409 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 SULT1C4O75897 302 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 RAB40BQ12829 278 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ZMYND11Q15326 602 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM201AQ5SY85 155 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 C6orf141Q5SZD1 244 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR86Q86TI4 376 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 KLBQ86Z14 1044 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ELMOD2Q8IZ81 293 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 OR8S1Q8NH09 359 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 Q9H521 79 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 TGFAP01135 160 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV2-5P01817 119 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 GRPP07492 148 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 GNALP38405 381 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMB10P40306 273 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 BTG1P62324 171 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 PRDX4Q13162 271 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF181Q2M3W8 571 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 CDONQ4KMG0 1287 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 CATSPERDQ86XM0 798 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ACBD7Q8N6N7 88 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 SPERTQ8NA61 448 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 OR52I1Q8NGK6 324 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 LPAR2Q9HBW0 351 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 UBAP1Q9NZ09 502 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF850A8MQ14 1090 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 IFNL4K9M1U5 179 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 P2RY10O00398 339 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 MAP2K3P46734 347 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ODF4Q2M2E3 257 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM166AQ6J272 317 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM220AQ7Z4H9 259 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 LINC01356Q8N9X3 169 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 Q8TCH9 128 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 PIGCQ92535 297 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 GGHQ92820 318 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 ITPKCQ96DU7 683 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A1B0GTI1 187 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC1A7O00341 560 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 CST4P01036 141 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 OR12D2P58182 307 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 KLHL22Q53GT1 634 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF826PQ6ZT77 177 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 LHFPL3Q86UP9 236 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 FTMTQ8N4E7 242 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 ERGIC1Q969X5 290 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 FN3KRPQ9HA64 309 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 C14orf119Q9NWQ9 140 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 SVEP1Q4LDE5 3571 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 NAV3Q8IVL0 2385 aa22.26■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 FADS2O95864 444 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHA1P01876 353 aa22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 FAHP16930 419 aa22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR38Q5JTN6 314 aa22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GTF3C4-202ENST00000483873 PRSS35Q8N3Z0 413 aa22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms