RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481019.5

PTPRF-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 459 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-213	ENST00000481019	OR8B4	Q96RC9	309 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ZNF649	Q9BS31	505 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	SP140L	Q9H930	580 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	GNG8	Q9UK08	70 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	SSR3	Q9UNL2	185 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	COPS3	Q9UNS2	423 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	CUBN	O60494	3623 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ACOD1	A6NK06	481 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	SLC22A1	O15245	554 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	PLPP2	O43688	288 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	CSF3	P09919	207 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	H2BFM	P0C1H6	154 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	RAC2	P15153	192 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	SLC25A16	P16260	332 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	GABRA5	P31644	462 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	TPTE	P56180	551 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	OR12D2	P58182	307 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ZNF92	Q03936	586 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	KLB	Q86Z14	1044 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	RDH5	Q92781	318 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	YIPF6	Q96EC8	236 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	KCNJ15	Q99712	375 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ZNF878	C9JN71	531 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	NDUFS8	O00217	210 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	PSMD9	O00233	223 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	MLNR	O43193	412 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	AIRE	O43918	545 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ADH4	P08319	380 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	CEL	P19835	753 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	SLC6A9	P48067	706 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	CX3CR1	P49238	355 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	CCR9	P51686	369 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	LIPN	Q5VXI9	398 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	DRAM2	Q6UX65	266 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	PHC2	Q8IXK0	858 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	PHYHIP	Q92561	330 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	OPALIN	Q96PE5	141 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	GPR160	Q9UJ42	338 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	STUB1	Q9UNE7	303 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	PLSCR5	A0PG75	271 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	TMEM212	A6NML5	194 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019		J3QW42	95 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	OGG1	O15527	345 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	CD55	P08174	381 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	SELE	P16581	610 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	TUBG1	P23258	451 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	HSD11B1	P28845	292 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	LIPA	P38571	399 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	CRYBB2	P43320	205 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	MOG	Q16653	247 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	TP53I3	Q53FA7	332 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	AVPI1	Q5T686	147 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	FDX2	Q6P4F2	183 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	FAM57B	Q71RH2	274 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPRF-213	ENST00000481019	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		10.35	□□□□□ -0.75

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