RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-215ENST00000480416 MTERF3Q96E29 417 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 MALSU1Q96EH3 234 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ZNF583Q96ND8 569 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 GAFA1Q96PS6 74 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 OR5B12Q96R08 314 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 CCT7Q99832 543 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ATF6BQ99941 703 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 SLC25A33Q9BSK2 321 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 C1orf50Q9BV19 199 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 TMED9Q9BVK6 235 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 WDR13Q9H1Z4 485 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ISYNA1Q9NPH2 558 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 LZTFL1Q9NQ48 299 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 POLE3Q9NRF9 147 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 C19orf12Q9NSK7 152 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 GLS2Q9UI32 602 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 PITPNC1Q9UKF7 332 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 A0A0J9YWU9 116 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 HTR3EA5X5Y0 456 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 CCDC154A6NI56 674 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ZNF785A8K8V0 405 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ODF3BA8MYP8 253 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 TMEM233B4DJY2 109 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 SLC28A1O00337 649 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 IMPA2O14732 288 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 SLC16A6O15403 523 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 TPST1O60507 370 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 PEX11AO75192 247 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 CDK2AP2O75956 126 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 CH25HO95992 272 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 IGHG1P01857 330 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 CST2P09228 141 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 NR2F1P10589 423 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 UQCRBP14927 111 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ACADSP16219 412 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 MALP21145 153 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 GGT2P36268 569 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 CDKN2CP42773 168 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 GSK3BP49841 420 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 SLC25A1P53007 311 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 PRKAA2P54646 552 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 CSNK2BP67870 215 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ZNF273Q14593 569 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 OR8G1Q15617 311 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 MICBQ29980 383 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 LRRC10Q5BKY1 277 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ALG10BQ5I7T1 473 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 GPR139Q6DWJ6 353 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 PLBD1Q6P4A8 553 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 TMEM65Q6PI78 240 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 PIGWQ7Z7B1 504 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 DHDDSQ86SQ9 333 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ZNF429Q86V71 674 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ZNF440Q8IYI8 595 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 DPP10Q8N608 796 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 CCNYL1Q8N7R7 359 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 NPEPL1Q8NDH3 523 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 NOXO1Q8NFA2 376 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 OR5D13Q8NGL4 314 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 OR8U1Q8NH10 309 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 LRRC29Q8WV35 223 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 STMN2Q93045 179 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 RFKQ969G6 155 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 L3HYPDHQ96EM0 354 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 CCDC115Q96NT0 180 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 SEPHS2Q99611 448 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 PARD6BQ9BYG5 372 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 DPH5Q9H2P9 285 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 GNB4Q9HAV0 340 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 SELENONQ9NZV5 590 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 P2RX2Q9UBL9 471 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 TMCO1Q9UM00 188 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 ANGPT4Q9Y264 503 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 LRP2P98164 4655 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.44□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 A0A1W2PPL8 197 aa2.44□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 NUPR2A6NF83 97 aa2.44□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 A6NLC8 198 aa2.44□□□□□ -2.02
TNS1-215ENST00000480416 SERPINE3A8MV23 424 aa2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms