RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 PPP1R2P9O14990 202 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 LIMS3P0CW19 117 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 LIMS4P0CW20 117 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 SOX8P57073 446 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 RNF212Q495C1 297 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CLLU1Q5K131 121 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 B9D1Q9UPM9 204 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 AIPO00170 330 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ARPC3O15145 178 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 PTAFRP25105 342 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ID4P47928 161 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 PSG6Q00889 435 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 STEAP1BQ6NZ63 245 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 MRGPREQ86SM8 312 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 MFSD4AQ8N468 514 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 SMIM3Q9BZL3 60 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 FBXO24O75426 580 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 TAS2R30P59541 319 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 SFRP5Q5T4F7 317 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 OR8D4Q8NGM9 314 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 GCM1Q9NP62 436 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 SBF1O95248 1867 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 SPAG17Q6Q759 2223 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 TMEM127O75204 238 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 GIPP09681 153 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 RAB1AP62820 205 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 MDGA2Q7Z553 956 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 NAA40Q86UY6 237 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 GABRG1Q8N1C3 465 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 CES1P1Q9UKY3 287 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PQD3 144 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 IFITM5A6NNB3 132 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 TXNDC12O95881 172 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 UBE2KP61086 200 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 DOC2BQ14184 412 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SLC17A1Q14916 467 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 FAM27D1Q5T7N8 215 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 BRICD5Q6PL45 260 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 OR1F12Q8NHA8 337 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 ACKR4Q9NPB9 350 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 MSTNO14793 375 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 PMPCAQ10713 525 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 HFEQ30201 348 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 GLCCI1Q86VQ1 547 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 DEFB108BQ8NET1 73 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 EDARADDQ8WWZ3 215 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 FRZBQ92765 325 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 PILRBQ9UKJ0 227 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 PCM1Q15154 2024 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 M0QZ24 198 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SSX1Q16384 188 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 CSRP2Q16527 193 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 DCAF10Q5QP82 559 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 OTPQ5XKR4 325 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 THSD4Q6ZMP0 1018 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SLC25A32Q9H2D1 315 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 CYSLTR2Q9NS75 346 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 TAS2R4Q9NYW5 299 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 ST8SIA5O15466 376 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 GSK3AP49840 483 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 MVDP53602 400 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 OR2G2Q8NGZ5 317 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 OR10D3Q8NH80 312 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 OR2AE1Q8NHA4 323 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 GPR119Q8TDV5 335 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 VSTM2LQ96N03 204 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 GPR84Q9NQS5 396 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 ANK1P16157 1881 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SRP14P37108 136 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 CRYBB2P43320 205 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 FUT6P51993 359 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 AKR1C1Q04828 323 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SLC23A3Q6PIS1 610 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 CBLN3Q6UW01 205 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SFTPA2Q8IWL1 248 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 RAB1CQ92928 201 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SEC22AQ96IW7 307 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SIGLEC11Q96RL6 698 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 SRRQ9GZT4 340 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
NISCH-207ENST00000479054 FUT7Q11130 342 aa12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms