RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 TGFBR3Q03167 851 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MICBQ29980 383 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 FAM209BQ5JX69 171 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 LIN54Q6MZP7 749 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MZT2AQ6P582 158 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 AHSA2Q719I0 299 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SERPINA11Q86U17 422 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 LINC01006Q8NI28 216 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 FAM162AQ96A26 154 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PHF21AQ96BD5 680 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 BOD1Q96IK1 185 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 Q96MT0 163 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF583Q96ND8 569 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MGLLQ99685 303 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MMP28Q9H239 520 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 EXD2Q9NVH0 621 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SSR3Q9UNL2 185 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.65□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.65□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 IRGMA1A4Y4 181 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 DUXAA6NLW8 204 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 M0R233 179 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 SULT1C2O00338 296 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 FAAHO00519 579 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 PLA2G10O15496 165 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 FABP7O15540 132 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 CHP2O43745 196 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 RP2O75695 350 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 KRT33AO76009 404 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 GPANK1O95872 356 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 GUSBP08236 651 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 ANXA8P13928 327 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 GALP22466 123 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 UQCRC2P22695 453 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 SLC6A1P30531 599 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 INPP1P49441 399 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 MVDP53602 400 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 CLDN17P56750 224 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 EGR4Q05215 589 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 PUDPQ08623 228 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 PYDC2Q56P42 97 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 AVPI1Q5T686 147 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 UQCC3Q6UW78 93 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM123Q8N131 208 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 OR2T4Q8NH00 348 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 OR52N1Q8NH53 320 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 OR5M11Q96RB7 305 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 CRLF2Q9HC73 371 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 GPR35Q9HC97 309 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 MLXQ9UH92 298 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 NPTNQ9Y639 398 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 TENM2Q9NT68 2774 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 COL7A1Q02388 2944 aa6.64□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.63□□□□□ -1.35
SZRD1-208ENST00000476423 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms