RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 KCNS1Q96KK3 526 aa2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 CTRCQ99895 268 aa2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 EMC6Q9BV81 110 aa2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 NUDT9Q9BW91 350 aa2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 REEP1Q9H902 201 aa2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 CRLF2Q9HC73 371 aa2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 DYRK4Q9NR20 520 aa2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa2.66□□□□□ -1.98
PRPF40A-208ENST00000472760 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC22A20A6NK97 555 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 A8MUU9 505 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 BTNL10A8MVZ5 291 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 HACD1B0YJ81 288 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 K7EM74 188 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 LGALS9O00182 355 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 CTNSO60931 367 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 IGKV1-17P01599 117 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 RPN2P04844 631 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 CD5P06127 495 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 CELP19835 753 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 TUBG1P23258 451 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 PEX19P40855 299 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 OR1G1P47890 313 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 BCAP31P51572 246 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 CLDN6P56747 220 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 TSC22D1Q15714 1073 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 HADHQ16836 314 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 FAM222AQ5U5X8 452 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 ULK3Q6PHR2 472 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC30A8Q8IWU4 369 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 OR1L1Q8NH94 360 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 C18orf15Q96N68 181 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 RGCCQ9H4X1 137 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 FBXO8Q9NRD0 319 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 TUBG2Q9NRH3 451 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 TREX1Q9NSU2 369 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 LRRC42Q9Y546 428 aa2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 COL1A2P08123 1366 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 DOCK9Q9BZ29 2069 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 H3BN98 237 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 M0R1X1 148 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 MSR1P21757 451 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 GABRR2P28476 465 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 DAOAP59103 153 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 LCN2P80188 198 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 FUT5Q11128 374 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 OR1Q1Q15612 314 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 PRR9Q5T870 116 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 MFSD14CQ5VZR4 134 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 NDUFAF7Q7L592 441 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 DRAM1Q8N682 238 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 ENKURQ8TC29 256 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM159Q96B96 161 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 RDH12Q96NR8 316 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 SFXN3Q9BWM7 321 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 IL22Q9GZX6 179 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 PRSS16Q9NQE7 514 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 CES1P1Q9UKY3 287 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa2.64□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 A0A0A6YYD5 115 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 MYL12BO14950 172 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 SCO1O75880 301 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 LCA5LO95447 670 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 TRBV12-3P01733 135 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 THRAP10827 490 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 PRKACBP22694 351 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 C6orf99Q4VX62 202 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF101Q8IZC7 436 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 APCDD1LQ8NCL9 501 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 OR5T3Q8NGG3 340 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 OR1S1Q8NH92 325 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 RXFP2Q8WXD0 754 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 PCM1Q15154 2024 aa2.63□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 NOTCH2Q04721 2471 aa2.62□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 CENPXA8MT69 81 aa2.62□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 CENPBD1B2RD01 187 aa2.62□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 UPK1BO75841 260 aa2.62□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 ARL2P36404 184 aa2.62□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 TAS2R39P59534 338 aa2.62□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 PAFAH1B2P68402 229 aa2.62□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM236Q5W0B7 351 aa2.62□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 LINC00336Q6ZUF6 198 aa2.62□□□□□ -1.99
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC35G3Q8N808 338 aa2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms