RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF879B4DU55 563 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 GPR37O15354 613 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ATP5HO75947 161 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 CST4P01036 141 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 GYPAP02724 150 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ATP6V1B1P15313 513 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ALOX5APP20292 161 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 SLC2A5P22732 501 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ANOS1P23352 680 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 DCTDP32321 178 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 GNALP38405 381 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 RASSF2P50749 326 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 CRISP1P54107 249 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 FGF12P61328 243 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ESRRGP62508 458 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 IL5RAQ01344 420 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 GPR157Q5UAW9 335 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 C16orf87Q6PH81 154 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 KRT74Q7RTS7 529 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 KRT77Q7Z794 578 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 TECTBQ96PL2 329 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 AMELYQ99218 206 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 NOX4Q9NPH5 578 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 BRD7Q9NPI1 651 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 A0A0U1RQV5 110 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM210A6NLX4 147 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 POM121CA8CG34 1229 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 C22orf46C9J442 243 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 DVL1O14640 695 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 CDIPTO14735 213 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 TMPRSS2O15393 492 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 SELENOFO60613 162 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF254O75437 659 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 TOX4O94842 621 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 MAP2K3P46734 347 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 DAPP51397 102 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ACTR3P61158 418 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 BNIP1Q12981 228 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 APOFQ13790 326 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 PDCD1Q15116 288 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 AWAT1Q58HT5 328 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 FAHD1Q6P587 224 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 WDR82Q6UXN9 313 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC29Q8WV35 223 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 PIGCQ92535 297 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ITPKCQ96DU7 683 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 RNF170Q96K19 258 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 WDFY2Q96P53 400 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF747Q9BV97 191 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 MROQ9BYG7 248 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRF-210ENST00000463041 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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