RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 HTR3EA5X5Y0 456 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 A8MVM7 634 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL24O00175 119 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFA2O43678 99 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 BANF1O75531 89 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 STX11O75558 287 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 UGT2B17O75795 530 aa3.14□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 KRT6AP02538 564 aa3.14□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 PNMTP11086 282 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 GSTM3P21266 225 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 STOMP27105 288 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 PMELP40967 661 aa3.14□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGDIAP52565 204 aa3.14□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 SCN1BQ07699 218 aa3.14□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 UBE2V1Q13404 147 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 SMU1Q2TAY7 513 aa3.14□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 PRR27Q6MZM9 219 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 Q6ZR03 302 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 COLCA1Q6ZS62 124 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM219Q86XT9 240 aa3.14□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.14□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 PIFOQ8TCI5 191 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 GRK7Q8WTQ7 553 aa3.14□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.14□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.14□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 A6NDX4 124 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF726A6NNF4 738 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 VGLL3A8MV65 326 aa3.13□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 FAAHO00519 579 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 AIM2O14862 343 aa3.13□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 FCMRO60667 390 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 FMO6PO60774 539 aa3.13□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 BAG2O95816 211 aa3.13□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 GP9P14770 177 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ETS2P15036 469 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP6V1B1P15313 513 aa3.13□□□□□ -1.91
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ECHDC1-211ENST00000460558 KITLGP21583 273 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 PAX6P26367 422 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 CSNK1A1P48729 337 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 DLX1P56177 255 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 DLG1Q12959 904 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 BNIP2Q12982 314 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 GRTP1Q5TC63 336 aa3.13□□□□□ -1.91
ECHDC1-211ENST00000460558 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.13□□□□□ -1.91
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