RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	SERPINA5	P05154	406 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF20	P17024	532 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR3	P46089	330 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	FMOD	Q06828	376 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	BAP18	Q8IXM2	172 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR119	Q8TDV5	335 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	KNG1	P01042	644 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	GIMD1	P0DJR0	217 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	MPZ	P25189	248 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	CD80	P33681	288 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	EMP2	P54851	167 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	GAGE1	Q13065	139 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	EMC4	Q5J8M3	183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR4K15	Q8NH41	348 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF128	Q8TEB7	428 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	DDA1	Q9BW61	102 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	C1orf198	Q9H425	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A1B0GV50	99 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SCGB1D2	O95969	90 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	ARG1	P05089	322 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	PGC	P20142	388 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	VEGFB	P49765	207 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SCAND1	P57086	179 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	HNF4G	Q14541	408 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	DEFB119	Q8N690	84 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	EDA	Q92838	391 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	TSLP	Q969D9	159 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	KIRREL1	Q96J84	757 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157		H3BML4	177 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157		K7EQS6	105 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	ADAP1	O75689	374 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	NAAA	Q02083	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF117	Q03924	483 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	HMGN3	Q15651	99 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR2A2	Q6IF42	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	LCN10	Q6JVE6	187 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	EMC6	Q9BV81	110 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	BANF2	Q9H503	90 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	VDAC3	Q9Y277	283 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	REV3L	O60673	3130 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A1W2PPE2	198 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	CYTIP	O60759	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SOD3	P08294	240 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM11	P17152	192 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SULT1A1	P50225	295 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR52N5	Q8NH56	324 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	FCGR3A	P08637	254 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	THEGL	P0DJG4	465 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	HSD11B1	P28845	292 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	NSDHL	Q15738	373 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SMIM8	Q96KF7	97 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	YPEL4	Q96NS1	127 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	S100A13	Q99584	98 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	MED29	Q9NX70	200 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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